台南市於前日（6/27）出現一起家族群聚感染事件，打破了連續11日的「零確診」紀錄。據悉，這起家族群聚源自於台南市安南區，從上到下祖孫三代一共8人確診，外界擔憂感染源是否為印度Delta變異毒株；今（29）日基因定序出爐。
日期：2021-06-29
中央流行疫情指揮中心今（28）日公布國內新增60例COVID-19確定病例，均為本土個案；另確診個案中新增3例死亡。
日期：2021-06-28
中央流行疫情指揮中心宣布今（27）日全國新增88例本土病例，台南新增8例本土確診個案，台南市長黃偉哲率市府團隊報告今日防疫重點。
日期：2021-06-27
屏東祖孫自秘魯回國感染Delta病毒，目前共造成12人的群聚感染，其中有8位的基因定序已經出來，確認感染的是Delta病毒！台北市長柯文哲在臉書上爆料，衛生局在今（27）日上午10點，接到疾管署臺北區管中心通知，一位感染Delta病毒的枋寮鄉居民，與兩位台北市民有過近距離的接觸；目前已先立刻安排至陽明醫院進行採檢，並且到檢疫所進行隔離，也已進行PCR採檢。
日期：2021-06-27
中央流行疫情指揮中心今(26)日公布國內新增78例為本土個案，死亡案例則有13例。由於屏東自秘魯返台祖孫確診感染印度Delta病毒，加上後續接觸者有12人群聚事件，今日病毒基因定序結果出爐，其中6例經基因定序後，均為Delta印度變異株。
日期：2021-06-26
北農群聚感染風波持續延燒，為了遏止疫情持續、感染範圍擴大，經中央流行疫情指揮中心與雙北市府討論後，正式於6月24日成立專案小組。指揮中心加強3大措施，包括台北市第一果菜批發市場和環南市場須進行全員採檢等。
日期：2021-06-25
雖說國內COVID-19每日確診數有下降的趨勢，傳播力也持續下降，整體疫情明顯趨緩，不過，中央流行疫情指揮中心副指揮官陳宗彥指出，北農群聚仍嚴重，地方政府應加強相關人員篩檢、健康監測。同時，社區篩檢、疫調仍須持續加強，接觸匡列者也要追蹤管理，繼續監測印度Delta變異毒株的動向。
日期：2021-06-25
新竹縣今天（24日）新增5例新冠肺炎確診案例，為案14402、14403、14404、14405和14458。案14402和14405為B機構照服員和住民，分別因工作需求和安置機構控管需求而採檢確診。案14403和14404則為B醫療機構住院病患和照服員，2人皆因為昨日案14353確診而被匡列居隔並採檢，結果陽性確診。案14458則是宜蘭縣確診者案14333的接觸者，被匡列居隔後採檢確診；以上5例均已收治病房或集中檢疫所隔離治療。
日期：2021-06-24
新北市板橋區萬板大橋於上周六（6/19）發生一起車禍，一名林姓男子下班後騎機車要返回新莊住家時，突然自撞水泥牆昏迷，經送醫救治，並採檢後，遭醫院確診為感染新冠肺炎（COVID-19）。據悉，該男子為北農送貨司機，已發燒一個多月，卻只吃退燒藥來躲避體溫監測；當時負責處理事故的3名警員獲報後緊急進行PCR、快篩，所幸均為陰性反應。
日期：2021-06-23
中央流行疫情指揮中心今(23)日表示，針對臺北農產運銷公司發生COVID-19群聚感染事件，指揮中心於昨(22)日召開會議，與農委會、臺北市政府、臺北農產運銷公司共同討論疫情狀況並研商「市場專案」強化相關防疫作為，積極協助地方政府及廠商進行防疫，避免感染擴大。
日期：2021-06-23
