台北市某一防疫旅館已知有3人確診，經病毒基因定序後，結果出爐3人全數感染「Omicron變異株」，由於3名個案倆倆之間的基因定序分別有2到4個位點的差異，目前仍不排除為旅館群聚。不過，3人的發病日、傳染途徑仍有無法解釋之處，中央流行疫情指揮中心持續調查中。
日期：2022-01-01
中央流行疫情指揮中心今(26)日公布國內新增24例COVID-19確定病例，分別為1例本土及23例境外移入；另確診個案中無新增死亡。
日期：2021-12-26
桃園防疫旅館爆群聚，起因於一名自中國返台的40多歲男性，在自主健康管理期間爆出確診，疫調回溯後發現，該旅館整棟樓共有8人確診，其中6人都處同一層樓；對此，台大感染症專家黃立民認為，空調傳播機率很高，如果真是如此，恐怕有更多人染疫。
日期：2021-12-17
中央流行疫情指揮中心今（16）日公布，新增一名12日由美國境外移入的50多歲男性（案16855）感染Omicron確診，同班機8名旅客已經緊急安排居家隔離，目前全台累積4例Omicron確定病例，分別來自史瓦帝尼、英國與美國。
日期：2021-12-16
中央流行疫情指揮中心今(16)日公布國內新增12例COVID-19境外移入確定病例，分別為1例本土及11例境外移入；另確診個案中無新增死亡。
日期：2021-12-16
中研院P3實驗室人員染疫個案（案16816），最新的病毒基因定序出爐，個案感染的病毒與P3實驗室使用Delta變異株相符，判定是實驗室的病毒，並非社區感染！不過，（案16816）是被Alpha的老鼠咬到，但實驗室並非只操作同一病毒株，詳細確切受到感染的原因還要更進一步調查。
日期：2021-12-11
中央流行疫情指揮中心昨（10）日公布國內新增16例COVID-19境外移入確定病例。10日公布境外移入病例（案16829），為「南非」入境的本國籍30多歲女性；指揮官陳時中今更正表示，經確認該案是從史瓦帝尼經南非轉機入境，確認其感染Omicron變異株，也是我國首例確定個案。
日期：2021-12-11
中央研究院昨（9）日驚傳一起新冠（COVID-19）本土案例，為一名女性研究人員確診，讓本土疫情再拉警報，引發國內恐慌。針對這起本土案例，有消息指出個案是遭到「染疫的實驗老鼠」咬到，進而被傳染，且遭咬傷的次數為2次，對於這項說法，台北市長柯文哲今（10）日在記者會上坦言，根據目前醫學知識，全球並沒有動物傳到人的案例，研判是實驗室病毒外洩。不過，中央流行疫情指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞今（10）日也於記者會上提出國際資料證實，「動物傳人」的傳染途徑是有可能的，且發生在多個國家過。
日期：2021-12-10
中央流行疫情指揮中心證實，中研院P3實驗室一名20多歲女性人員確診新冠肺炎，其Ct值低（第一次15；第二次23），為30幾天來0本土的首例！對此，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中昨晚第一時間開記者會表示，現在最重要的還是對社區第一層的接觸者做檢驗，如果PCR都是陰性就表示疫情不會往外擴散，那就會比較安心一點；但如果另外有人員染疫，那另外一波的疫調就要展開。台北市長柯文哲也於今早開記者會表示，就統計上機率來說，全台灣已經0本土30幾天了，受社區的感染機率很小，台北疫調小組將繼續去中研院做詳細調查，在醫學上不認為動物會感染到人，但怎麼外洩的，包括人員，必要時要加做抗體 ，把環境檢查一遍。
日期：2021-12-10
中央流行疫情指揮中心今(4)日公布國內新增2例COVID-19確定病例，分別為1例本土個案及1例境外移入；另確診個案中無新增死亡。
日期：2021-11-04
