中央流行疫情指揮中心今(29)日公布國內新增54例COVID-19確定病例，均為本土個案；另確診個案中新增8例死亡。另外，針對屏東Delta病毒群聚案件，指揮官陳時中指出，枋寮果農（案14734）的基因定序提前出爐，確定感染了Delta變異病毒株！而該名患者的妻子（案14816）也染疫，不過目前基因定序結果尚未出爐。
日期：2021-06-29
國內今（28）日新增60例本土病例、3例死亡，其中，新北市新增33例確診最多，截至今日，新北累計確診人數共6442人。新北市長侯友宜於下午記者會中，指出烏來區首度出現確診，並點名四個區仍須密切注意，同時，提出應建立「全境快速通報機制」，以防範Delta變種病毒。
日期：2021-06-28
中央流行疫情指揮中心今（28）日公布國內新增60例COVID-19確定病例，均為本土個案；另確診個案中新增3例死亡。
日期：2021-06-28
屏東祖孫自秘魯回國感染Delta病毒，截至昨（26）日共造成12人的群聚感染，當中指揮中心公布包含秘魯祖孫總計6人確認「感染的是Delta病毒」，另外4起，分別是白牌車司機，及司機乘客與其同住者祖孫。今（27）日疫情記者會上公布部分基因定序個案結果，再新增2人驗出Delta病毒株，目前確認共8位；雖然結果還未全數完成，但指揮官陳時中口頭表示，「群聚12人中，有驗出來的都屬於Delta病毒株。」可見傳染力相當的驚人！
日期：2021-06-27
中央流行疫情指揮中心今(27)日公布國內新增89例COVID-19確定病例，分別為88例本土及1例境外移入；另確診個案中新增9例死亡。
日期：2021-06-27
中央公布，今天台北市有30例本土案例，全島死亡人數是13例。在下午的台北市防疫記者會中，市長柯文哲表明今天主軸的兩個議題：台北市在疫情中的戰略思考以及北農案子。
日期：2021-06-26
中央流行疫情指揮中心今(26)日公布國內新增78例為本土個案，死亡案例則有13例。由於屏東自秘魯返台祖孫確診感染印度Delta病毒，加上後續接觸者有12人群聚事件，今日病毒基因定序結果出爐，其中6例經基因定序後，均為Delta印度變異株。
日期：2021-06-26
國內COVID-19疫情今（25）日新增76例本土病例、5例死亡，其中台北市新增20例確診，北市府駐衛警同仁也傳出確診。台北市長柯文哲下午在疫情記者會上說明，「北農專案2.0」下周起全面進行PCR；北市府駐衛警同仁已施打過疫苗仍確診，目前已匡列13位接觸者，PCR皆為陰性，居家隔離中。針對疫苗殘劑施打，柯文哲表示將授權診所處理。另外，印度Delta病毒入侵台灣，柯文哲直言「要學著與病毒共存才是新常態」。
日期：2021-06-25
全國COVID-19確診病例數今（25）日新增76例，其中新北市確診數為32例，創下疫情爆發以來新低。從新北市境內個別區域來看，板橋區10人最多，其次為新店5人、三重及中和各4人。
日期：2021-06-25
北農群聚感染風波持續延燒，為了遏止疫情持續、感染範圍擴大，經中央流行疫情指揮中心與雙北市府討論後，正式於6月24日成立專案小組。指揮中心加強3大措施，包括台北市第一果菜批發市場和環南市場須進行全員採檢等。
日期：2021-06-25
