部立桃園醫院COVID-19（武漢肺炎）群聚感染，昨（2）日傳出有轉院患者於上月29日因「肺炎」死亡；對此，中央流行疫情指揮中心發言人莊人祥表示，該個案在轉院期間曾數次採檢，包括昨日死亡後也立即採檢，結果皆呈陰性，詳細的死因仍待法醫判定。目前部桃群聚感染事件，似乎有逐漸趨緩之勢，何時能夠重新恢復營運？指揮官陳時中也在記者會上回應。
日期：2021-02-03
台北市前衛生局長邱淑媞日前批評，中央流行疫情指揮中心有「要命的邏輯錯誤」，引發熱烈討論，不少網友提起2003年SARS當時所做出「和平醫院封院」決策才是錯誤，邱淑媞也不甘示弱地貼出當年公文反擊，稱不是自己的錯，全甩鍋給中央；對此，前行政院衛生署長涂醒哲怒提「5大重點」還原當時和平醫院封院的始末，更直言「事實就是事實，但因為邱淑媞拿出公文想要甩鍋，我在此說明。」
日期：2021-01-26
今日公布國內新增2例本土COVID-19確定病例，1人為該院出院病患(案889)，另1人為該案889之同住家人(案890)。指揮中心指揮官陳時中，下午記者會上，解釋為何部桃選擇「只出不進」策略，他說明不論是選擇什麼策略，院內都還是需要做出區隔，這是必然要做的；而選擇「只出不進」是因為，能讓醫療量能已經變低的醫院，藉由最好的防護轉出病患，降低負荷，也能更有效的管控醫院風險，但此方式還是有缺點，在於出院的病患會有社區感染的風險，管理上需要做到很嚴謹。
日期：2021-01-24
國內疫情持續擴大，日前才傳出北部醫院有2醫護染疫，成為台灣第一例醫師確診個案，前天（16日）又新增一名20多歲護理師確診（案852），昨（17）日再新增一名30多歲醫師（案856），今（18）日竟再增加一名護理師確診（案863），使院內群聚感染風暴不斷擴大，封院的聲浪也隨之變高。有專家指出，想要阻隔醫院感染散開，應該要考慮封院規劃；不過，也有醫師持反對意見，認為封院一舉根本不合理。
日期：2021-01-18
國內日前爆發本土案例，染疫者是照顧新冠肺炎患者的醫師與護理師，這起院內感染事件震驚社會，過往對於已知訊息通常會立即發布，不過當天中央流行疫情指揮中心卻沒有任何動作，直到隔天下午才對外證實，引發外界質疑不早點公布的原因；對此，今（14）日早上指揮官陳時中說明當時的緊急作業流程，更指出「當晚全院的人都沒睡覺，緊急召回關係接觸者採檢。」
日期：2021-01-14
指揮中心醫療應變組副組長王必勝，稍早在個人臉書上透露，日前染疫醫師的狀況，他表示醫師狀況穩定，而所有的醫護人員也會盡全力照料作戰的同袍。
日期：2021-01-13
為了慎防新冠病毒變異株進入國境，世界多國都宣布暫時禁止英國航班，台灣卻沒有禁止。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中表示，台灣有管理優良的集中檢疫所，充足的醫療量能，所以不需要鎖國，只要做好「檢疫前後採檢、集中檢疫」這兩大戰略，就能有效防疫。
日期：2020-12-28
新冠肺炎境外移入案例屢次飆高，指揮中心端出新制，要求旅客須出具採檢陰性證明，才能登機來台，但專家認為，與其執著未必精準的報告，更應增加隔離期滿前的強制篩檢，以免錯放輕症患者進入社區。
日期：2020-12-09
「印尼政府傾向蓋牌不檢驗，一日都能新增6千多例了，代表背後的感染人口比例非常非常高！」胸腔科醫師蘇一峰早在11月底前，就在臉書上面不斷喊話提醒，他認為印尼的疫情基本上已經完全失控了，屬於是東南亞的重災區之一，台灣雖然有著種種理由必需倚賴印尼移工，但要想想如果沒有堅強的防禦印尼對策，「病毒靠著移工攻破國門絕非不可能！」
日期：2020-12-07
中央流行疫情指揮中心今（13）日公布國內新增8例境外移入COVID-19（武漢肺炎）確定病例（案591至598），分別自菲律賓（5例）、印尼（2例）及波蘭（1例）入境。
日期：2020-11-13
