本土疫情一波未平一波再起，自5月11日至今日，將近一個月的時間，累計確診者達10215人，有274人死亡，當中有不少從發病到死亡僅2、3天內的案例出現。而在公布國內新增36人的死亡人數中，有13人是死後才確診染疫的，對此外界質疑是否有更多黑數存在？對此指揮中心也回應了。
日期：2021-06-07
近期美國、日本紛紛送來新冠疫苗，讓外界好奇接下來新冠疫苗會怎麼來做施打？指揮中心今天坦言下週就要開始配發7萬Ｍoderna疫苗，另外指揮官陳時中坦言：「除了第一、二、三類的患者外，也將提供機構的長者、75歲以上長者、洗腎、指考員來進行施打。」
日期：2021-06-06
台北市疫情仍嚴峻，不過對於「鄰居」新北市醫療量能亮燈，台北市長柯文哲也伸出援手讓確診病患轉往北市就醫，但被問到是否要像其他縣市設置大型疫苗接種站，柯文哲快語表示「沒那麼多疫苗弄一個那麼大地方要幹嘛」；而他更針對民眾接種疫苗部分，霸氣宣布台北市之後接種新冠疫苗免費！
日期：2021-06-05
台灣本土疫情近期爆發，卻面臨國際採購疫苗供貨未及，日本政府拍板提供台灣124萬AZ疫苗，今天下午已送抵桃園機場。多家媒體報導，這批疫苗是總統蔡英文請與日本政界友好的副總統賴清德、及台日關係協會會長邱義仁居中牽線，低調運作多日後促成。台北市長柯文哲今於被媒體問及對此事的看法表示，「一個成功不會只有一個人，應該要感謝台灣人民過去311（福島核災）對日本的幫忙。」
日期：2021-06-04
國內疫情今（4）日新增339例本土、133例校正回歸。其中新北市確診164例、校正回歸63例，確診人數總計227例，累計確診人數4442人，居家隔離4754人。新北市長侯友宜下午召開疫情記者會，預估未來可能再面對新一波高峰，呼籲市民活動低度再低度，並成立「到宅快篩隊」，協助與家內確診者有接觸之老幼、身心障礙人士進行快篩。
日期：2021-06-04
台灣疫情三級管制至今雖然稍稍見效，但指揮中心坦言除了重災區雙北市以外的縣市，已經出現疫情增溫，且有不明感染源個案與群聚的現象，中央流行疫情指揮中心副指揮官陳宗彥呼籲地方政府，必須加強管理防止社區疫情爆發。另外，對於端午連假雙鐵運輸以及被隔離的租屋族權益，陳宗彥也一併說明指揮中心的新規定。
日期：2021-06-04
疫情重災區的雙北，隨著確診人數不斷往上攀增，醫療量能越來越緊繃，雙和醫院日前爆出護理師遭確診者砍傷，如今各個醫院的醫病衝突也越來越多，台大醫院企業工會昨晚也證實，有確診者不僅想要跑離隔離區域，甚至誇張到「用體液汙染公共環境」。台大醫院今（1）日召開記者會，除了說明第一線的防疫醫護目前所面臨到的困境，希望病人及家屬在疫情期間能夠多體諒醫護的立場與苦衷，也呼籲住院的隔離患者不要一直關注疫情的相關消息，避免影響情緒。
日期：2021-06-01
國內本土確診案例今（1）日新增262例本土、65例校正回歸，13人死亡。其中新北市確診127例最多、校正回歸39例。新北市長侯友宜下午在疫情記者會上表示，目前新北仍屬高風險區，「沒有樂觀的權利」。新北獲配發3.9萬劑疫苗，施打對象以醫護、警消與其他一線人員為主，預計五天內施打完畢。
日期：2021-06-01
新冠肺炎本土確診案例持續攀升、國內疫情持續嚴峻，加上近期疫苗爭議未解，社會人心惶惶。已近兩周沒有公開行程的總統蔡英文，下午發表公開談話，談防疫工作與疫苗進度。針對國內疫苗短缺問題，蔡英文先是感謝企業與宗教團體的義舉，表示相關部會將會協助，強調「絕對沒有阻擋的問題」。此外，她也強調國產疫苗為國家優先戰略，並嚴正駁斥「炒股說」，表示相關財產申報都是公開透明，可供查證；若有人指控，歡迎提出證據，一定會依法嚴查。
日期：2021-05-31
對於台北市長柯文哲呼籲，應拿「6300億元紓困預算的10分之1買疫苗」一事，行政院昨晚澄清，已編列115億元預算購買疫苗，之後還會新增224.5億元預算；不過，柯文哲今（30）日於疫情指揮記者會中質疑，「你預算都已經編了，加起來340億，那請問疫苗在哪裡？」
日期：2021-05-30
