由於傳染性更強的印度Delta變種毒株已入侵台灣，為了防範病毒擴散，以及更多病毒侵門踏戶，對此，政府要求入境一律全做PCR檢測。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中指出，一旦驗出「陽性者」，必須做病毒基因定序。
日期：2021-07-01
中央流行疫情指揮中心今(1)日公布國內新增50例COVID-19確定病例，分別為47例本土及3例境外移入；另確診個案中新增13例死亡。指揮官陳時中表示，整體解隔離有76.1%，整理來講個案數是往少的方向來走，7/12之後相關政策研議中，屏東個案現在來看，確實沒有向外擴的情況。
日期：2021-07-01
關島政府宣布自7月4日起，所有外國旅客只要持72小時前PCR陰性證明，就可入境免隔離，且關島總督Lou Leon Guerrero在臉書上表示，目前關島人民75%已完成疫苗接種，預計朝80%目標邁進，因此放寬入境標準。雄獅旅遊表示，上周因指揮中心宣布入境全面隔離措施後，確實有關島自由行的部分訂單因此取消。但在稍早關島政府宣布放寬入境標準後，又有訂單湧現，目前5天4夜行程中的2個梯次已額滿，預計全數機位近期可望全數完銷。另外，預期關島政府收取的「Air V&V」行政規費將從880美元調降，隨著需求湧現，雄獅今（30）日臨時決定，加開三梯次的7天6夜關島機加酒行程。
日期：2021-06-30
過去1個月以來，台灣面臨疫情高峰，奪走了600多條寶貴生命。近期疫情趨緩，呼籲指揮中心料敵從嚴，不得開放機組員於居檢期間可派飛出勤，以降低染疫風險。
日期：2021-06-30
國內今（28）日新增60例本土病例、3例死亡，其中，新北市新增33例確診最多，截至今日，新北累計確診人數共6442人。新北市長侯友宜於下午記者會中，指出烏來區首度出現確診，並點名四個區仍須密切注意，同時，提出應建立「全境快速通報機制」，以防範Delta變種病毒。
日期：2021-06-28
中央流行疫情指揮中心今（28）日公布國內新增60例COVID-19確定病例，均為本土個案；另確診個案中新增3例死亡。
日期：2021-06-28
屏東祖孫自秘魯回國感染Delta病毒，截至昨（27）日共造成12人群聚感染，其中包含秘魯祖孫總計8人確認感染的是「Delta病毒」，其餘4位的基因定序還未出來。對此，有網友質疑，6/6日回台祖孫，6/14日確診，期間居然可以感染給鄰居，甚至至第三層的白牌計程車司機；多數網友認為，「居家檢疫，完全不可行也不可信！」
日期：2021-06-28
新北市政府在今（27）天的防疫記者會上，公布板橋、中和等熱區確診數明顯下降，感謝民眾配合抗疫的辛勞。談到來勢洶洶的印度Delta變種病毒，新北市長侯友宜重申「阻絕於境外」的重要性。
日期：2021-06-27
屏東祖孫自秘魯回國感染Delta病毒，目前共造成12人的群聚感染，其中有8位的基因定序已經出來，確認感染的是Delta病毒！台北市長柯文哲在臉書上爆料，衛生局在今（27）日上午10點，接到疾管署臺北區管中心通知，一位感染Delta病毒的枋寮鄉居民，與兩位台北市民有過近距離的接觸；目前已先立刻安排至陽明醫院進行採檢，並且到檢疫所進行隔離，也已進行PCR採檢。
日期：2021-06-27
屏東祖孫自秘魯回國感染Delta病毒，截至昨（26）日共造成12人的群聚感染，當中指揮中心公布包含秘魯祖孫總計6人確認「感染的是Delta病毒」，另外4起，分別是白牌車司機，及司機乘客與其同住者祖孫。今（27）日疫情記者會上公布部分基因定序個案結果，再新增2人驗出Delta病毒株，目前確認共8位；雖然結果還未全數完成，但指揮官陳時中口頭表示，「群聚12人中，有驗出來的都屬於Delta病毒株。」可見傳染力相當的驚人！
日期：2021-06-27
