震災後四十八小時內，迅速撤離被困在校內的二千五百名師生，兩個星期內，決定替代的上課場所和教職員的安置處，在媒體上發表文章大批災後善後事務，直言國防部救援行動太緩，甚至引來連戰競選辦公室主任丁遠超的公開﹁關切﹂，暨南大學校長李家同在此次震災中的表現，在政界、學界都備受矚目，褒貶兩極，一如他平日行事、治校的風格。
刪減預算達成「不可能的任務」
七月一日才接任暨南大學校長一職，在短短兩個多月裡，李家同就以迅速明快的作風，為暨南大學立下了不少創舉，其中第一個達成的「不可能任務」，就是徹底地執行開源節流的工作。
由於本身專長資訊科技，李家同在治校方法上相當講求科學方法，他運用先進的電腦軟體來做學校的財務管理，每天早上花一個小時上網做會診，任何一筆支出都逃不過他的法眼，連高速公路的過路費單都要求做帳單編號，列入會計項目，在短短兩個星期內，他就親自審視了整個學校的預算，刪省了一千多萬元的人事預算。
此外， 暨南大學最近才完工的女生宿舍 B 棟，由於承包製作床具、書桌等廠商表示要到十月中旬才能製作完成，使得學校差一點無法順利開學，李家同也當機立斷，放棄訂做，改以統一採購的方式來進行，結果不僅宿舍家具在九月中旬已全部備齊，新生入學事務絲毫不受影響，而且全部只花了二百多萬元的經費，比原先一千兩百萬元的預算省了九百多萬元。
在各系所編列預算的方式上，李家同則摒棄一般學校「齊頭式平等」的舊習，融入「有競爭才有進步」的企業觀念，採用「肯做事的就多給錢」的做法，以達到資源充分運用的目的，並間接促發各系所的良性競爭。
值得一提的是，著有《讓高牆倒下吧》、《陌生人》等文學作品集的李家同，對於學生的通識教育也頗為注重，除了鼓勵中文系舉辦文學營、設立網站請專家學者為學生講解國際事務、編列預算請校內的教育系所為中小學學生編電子報外，有鑒於暨南大學校址偏僻，學生較難有機會參加藝文活動，李家同也撥下三百萬元的款項，請學務處多舉辦些音樂、畫展等活動，以豐富學生的精神生活。
此次暨南大學不幸遭臨地震災變，李家同仍以一貫明快的行事風格，帶領暨南大學的行政團隊，迅速處理災後重建的工作，其效率之高，幾可媲美於民間的大業。
例如， 因為地震而嚴重受損的電算中心網頁及 BBS 站，原本估計至少要兩個星期才能修復，但在李家同的指示下，電算中心的老師們在台大借用僅一、兩坪大的研究室中日夜趕工，結果不過兩天就已完全修復，正常使用。
此外，在學生及教職員的安置方面，李家同也透過關係向各方求援，在兩個星期內就做好各項因應措施，後在擴大行政會議中，也針對倉卒的決策過程向全校師生致歉，表示將承擔決策的一切後果，並承諾以後的決策將更透明化，不僅平息原本對決策過程不諒解的老師們的怒氣，也順利地化解了一場校園紛爭。
李家同「不尊重民意」
在暨南大學行政團隊成員的眼中，李家同是個急性子的人，在學校行政會議中，常見他一面主持會議，一面做筆記，會議一結束，馬上拿著自己所做的紀錄給與會的老師過目，確認沒問題後，就立刻請助理打字，發布決策，要求各單位迅速執行。
為了配合李家同要求的進度，負責執行的行政單位雖累得人仰馬翻，不過卻很少有人敢當面向他抱怨，一方面是震懾於他的強悍作風，一方面則是因為李家同也以相同的標準來要求自己，做的事不比下屬少，連帶地把人的嘴也給封了。
凡事講求效率、決策果斷，反應好又辯才無礙的李家同，在校務會議中經常等不及對方說完，就急著表達自己的想法，遇到不同的意見時，他則習慣打破砂鍋到底，常逼得對方張口結舌，而因為不善於刻意花心思去安撫人心，難免予人「不尊重民意」的感覺。
關於這點，李家同並不以為意，在接任暨南大學校長一職時，他就很清楚地跟學校老師提及：「台灣的校園民主是有問題的，凡事都要全校師生共同做決策，最後的結果就是效率不彰。」對李家同而言，被選出來當校長，就該被賦予更大的權限去處理校務，而無論決策成功與否，他都願意一肩扛起所有的錯誤，決不諉過。
不喜歡官僚作風，行政文書作業能省則省，強調劍及履及、立竿見影，這種「靂式」的另類治校風格，無論是在靜宜大學或是暨南大學，都引來教師們相當兩極化的評價，有人認為他有魄力、有擔當，有人批評他強勢獨斷、「無理性地苛求」，有人把他當神看，崇拜不已，也有人將他視為眼中釘，欲除之而後快。
沒有身段，平易近人的校長
儘管教師們的評價不一，在一般學生的心目中，李家同卻是個沒有身段、平易近人的校長。前不久才在《遠見雜誌》所舉辦的「大學生心目中最理想的校長」票選活動中名列前茅的他， 到暨南大學上任不久，就立刻在 BBS 站上開設校長板，在網路上直接與學生對話，而在平日的校園生活中，李家同也經常找學生一起吃飯，詢問學生對校務發展的看法，這種「平民化」的作風，為他贏得不少不少好評。
身為虔誠的天主教徒，李家同在繁忙的校務工作之外，也長期擔任德蘭教會的義工，到監獄裡幫受刑人補習英文，並和受刑人通信，鼓勵受刑人重新站起來，因白曉燕案近期內將槍決伏法的陳進興被捕後至今，也一直和李家同保持書信的往來。
在靜宜大學校長任期結束時，李家同就曾對外界表達要到監獄裡從事受刑人心理輔導工作，最後在盛情難卻的情況下，再度接下暨南大學校長的重責，原本以為可在山水秀麗的埔里鎮愉快地度過退休前的歲月，不料卻巧遇地震天災，有人為他感嘆「時運不佳」，而面對外界的種種流言與批評，他只簡單地表示：「重建工作優先，其他不予置評。」
李家同說：「等這任校長任期期滿，再教一年書，就要正式退休去當全職的義工。」至於功過褒貶，就留待後人去評斷了！
