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受到新冠肺炎疫情影響，觀光產業備受衝擊，交通部這半年多來，狂灑近五百億元在紓困、振興觀光相關產業，卻也導致觀光發展基金幾乎快要見底。根據最新一期觀光發展基金會報，截至六月基金收入，比原預算短收兩百五十億元，但支出卻增加四百一十億元，支出主要都用在紓困。
由於國境恐怕到今年底都不會開放，觀光局坦言，觀光發展基金的情況確實不是很樂觀，目前儘管運用上都沒有問題，但若明年國境都還不開放，可能不排除會舉債。
「觀光發展基金」設置目的主要是用在國際宣傳經費、地方政府大型活動行銷推廣、觀光設施興建維護等，其主要財源是來自出入境旅客繳納的「機場服務費」。
今年受到疫情影響，出入境旅客大幅減少。觀光局統計，今年截至五月底，來台旅客僅一百廿五萬餘人次，相較於去年同期五百零四萬餘人，銳減三百多萬人次；出境旅客約兩百一十四萬人次，相較於去年同期的七百零四萬餘人，一口氣少了近五百萬人。
出入境旅客銳減，導致機場服務費收入減少。根據最新一期觀光發展基金會報，截至六月底止，基金的勞務收入就短收兩百五十億元，短收比例超過百分之七十三；但是勞務成本卻因振興紓困預算大增，導致支出大幅增加百分五七五點六八、四百一十億元。
實際上，觀光局近年來多次運用觀光發展基金祭出國旅補助，導致基金用的相當快，去年底僅剩一百一十三億餘元，今年基金再度探底。
由於交通部七月推出安心旅遊補助，預算就有卅九億元，其中有十幾億是來自觀光發展基金。業界擔憂，認為今年觀光發展基金可能會見底，甚至還可能負債。
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