因為這個事情我交了新朋友，最深刻的是謝清志，
我不認識他，他來看我，也送我他寫的書，這種太多了⋯⋯，
我也碰過牧師當計程車司機，連續三次碰到他，最後還幫我禱告。
遭同僚誤會，也得到意想不到的支持
這三年，從雲端跌落所嘗到的人情冷暖，讓翁啟惠有了新的人生體悟。「那時候他（李遠哲）也不相信我，當然是很痛苦，我也講不清楚⋯⋯，但這種誤解你去釐清也沒有什麼用。」
足不出戶的那段時間，因為要參加學生父親的公祭，不得不出遠門到台中。一上高鐵，就發現有人一直跟在後面。緊張之下，他躲進廁所，沒想到對方也尾隨進去，最後不得已質問對方「到底要幹什麼？」才知道，對方是想幫他加油打氣。
翁啟惠說，那時候才恍然大悟，「原來不是所有人都像電視上的，都在罵我。」還是有人支持他。
翁啟惠這3年有老朋友打氣，更有暖心的新朋友。(圖片攝影/蕭芃凱)
陌生人送暖 七十歲走過人生最大噩夢
「這個案件讓我認識很多新朋友，像是謝清志、郭清江，都有來拜訪我。」航太科學家謝清志與郭清江，都曾是被控貪瀆而纏訟多年的公務員。落難科學家的心聲，也許只有同樣經歷的人才知曉。
不只如此，病人寫信給他、海外團體連署為他發聲，他驚訝極了。「好多連署的名字我都沒有來往呀。」
人生七十走過這一遭，翁啟惠曾坦言，「這是人生最大的噩夢。」的確，若留在美國，肯定比回台灣順遂。他大器晚成，快三十歲才拿到碩士學位，但一到美國很快就嶄露頭角，完成博士學業後，四年內就從助理教授升到正教授。四十歲出頭的年紀，就讓美國知名化學家理查．勒納（Richard Lerner）捧著千萬美元研究經費，延請他到新成立的斯克里普斯研究所（The Scripps Research Institute）。
他看到美國成功的產業經驗，回台之後他到處奔走，促成《生技新藥產業發展條例》，透過減稅、技術股鼓勵投資。當時業界和立法院幾乎都不贊成，業界更直白指出，台灣的環境根本做不來高階醫材和新藥。
「那為什麼台灣人出國就會發明這些呢？」翁啟惠反問。所有朋友都說他木訥少言，但由於他給了自己促進生技產業發展的任務，一天到晚都得不停地說，說到所有人能理解法規是打造友善生技產業的第一步，「要鼓勵投資者、鼓勵學界能夠投入這個高附加價值的領域，不能老是做代工，不然就業和薪資待遇會出問題。」
一七年技轉中研院技術、掛牌興櫃的醣基生醫，十幾項專利全是來自翁啟惠無償捐給中研院。翁啟惠不想拿技術股，「我不要因為自制法律而得利。」
期許台灣成為真正的法治國家
希望誤解到此為止，這是一個學習過程。我期許我們有一些法律規定要遵守：
偵查不公開、無罪推定原則⋯⋯這個不是傷害我而已，也是傷害國家。
「生技產業要的就是人才、資金及法律，我們是法治的社會，我認為我們真的有這個條件。」他看出台灣害怕面對失敗，不敢走高附加價值的創新產業，「但那是我回來的目的啊，我希望台灣能夠往真正創新的方向發展。」
真正要做事的人總會碰到許多挑戰，生技條例如此，國家生技園區如此，他一一克服了，「沒想到最困難的，發生在我自己身上。」
「這不只傷害到我，是傷害到中研院、生技產業、整個國家的司法制度。」翁啟惠盼望這個案子，能讓所有對技轉的誤解到此為止，「我還是正面去看，把這當作一個學習過程。希望法官寫幾百頁判決書，把它寫得很清楚。」
親友勸遠走美國 但他沒後悔過
如今，即使內線交易案已不起訴、貪污案一審判決無罪，經歷這番喧囂，親友都勸他回美國吧，台灣不要再待了。
但翁啟惠沒後悔過。「自己的決定怎麼會後悔？」蒙冤待雪的日子腥風血雨，唯一不變的是他全心投入的科學研究。翁啟惠仍舊天天準時到辦公室報到。
「不來工作，比生病還難受。」他難得笑了。
