二○一六年二月，浩鼎新藥解盲前後的一番發言，
讓聲譽卓著的中研院院長掉入輿論沸騰的地獄。
害怕別人眼光、不敢看新聞，連該得的國際獎項都不敢拿，錯過了諾貝爾獎。
從恐懼到鼓起勇氣，在一片罵聲之中，他不厭其煩重申自己的清白。
二○一八年十二月二十八日，法院宣判「無罪」，
這將近一千個日子，翁啟惠是怎麼走過來的？
二○一八年十二月二十八日上午十一點，浩鼎貪污案一審宣判，審判長才剛說完「無罪」兩個字，旁聽席上的翁家親友，立刻爆出一陣如雷掌聲與喜悅的啜泣。當事人中央研究院前院長翁啟惠和台灣浩鼎董事長張念慈都未到場，只有律師帶著一疊白紙黑字的聲明，代表翁啟惠發聲：「正義雖到，名譽難復，希望就此畫下句點。」
這份聲明稿，翁啟惠只寫了一個版本。「要我寫有罪版本的聲明稿，寫不出來。」勝訴了，電話裡他的聲音仍然溫涼得沒有起伏，「我一直都相信我是無罪的啊。」一審宣判前一個月，他接受《今周刊》專訪，就說自己不要證據不足的那種無罪，「我要實質的無辜。」
二○一七年起訴的首宗社會矚目重大案件
在法院文件上，浩鼎貪污案是「一○六年矚重訴案第一號」，代表一七年起訴的第一宗社會矚目重大案件，再前一年的一六年二月，「翁啟惠」開始頻繁登上媒體版面。
一六年二月二十一日，以翁啟惠研發技術成立的新藥股王浩鼎，股價在此前數個月內攀升逾倍，股民引頸期待的乳癌疫苗二／三期臨床試驗解盲成績，竟然是數據未達標。
解盲當天，翁啟惠接受記者採訪，指出問題出在試驗設計不良，但超過八成的病人有免疫反應，也產生抗體，這次試驗可以說「成效很好」。
這番話成了浩鼎案導火線。三月，他的女兒翁郁琇被爆出是浩鼎大股東，而翁啟惠代女兒在解盲前賣了十張股票的消息，愈傳愈失控。翁啟惠名字後頭出現的關鍵字，除了中研院院長，還多了一個「內線交易」。
至今，問他「會不會後悔，若當時沒有發言就好了？」翁啟惠回應：「不會，因為我一定要講事實。」他再三解釋：「我的意思就是說，施打疫苗的病人，假如有免疫反應的話，就有顯著療效⋯⋯」
