教育部退回台大遴選決議，台大需重新遴選校長。畢業於台大經濟研究所的學者吳嘉隆則在臉書表示「反對中國文化大學的人來當台大校長」，引起外界熱議，中國文化大學校友總會也發聲明譴責，要求其收回不當言論，且公開向文大師生和校友致歉。
台大校長遴選當選人管中閔大學畢業於文大，吳嘉隆在臉書上表示，他沒有說過只有台大人能當台大校長，但強調「只反對中國文化大學的人來當台大校長」，並指出歡迎所有不是中國文化大學的人經由正常程序當台大校長，因文大是當年大學聯考最後一名的學校，認為文大人身上共同的文化，完全不適合台大人。
此番言論引起許多網友抗議，認為吳嘉隆發言嚴重歧視。吳嘉隆再發言回應網友，認為網友的批評「對台大的提升有多少幫助？」，並表示「如果覺得台大人不行，那麼要先問有沒有別的更好的選項？如果有，那當初就會直接選擇別的選項，如果考慮過後選擇了台大人，而台大人表現不好，讓你不滿意，請問別人可以說你當初的選擇是不理性的嗎？」
中國文化大學校友總會也發聲明譴責，指出吳嘉隆言論歧視、眼界狹窄且傲慢，否定社會上大多數人努力的貢獻與成就，並嚴正請求吳嘉隆收回不當言論，並公開對文大師生和校友致歉。
吳嘉隆接受《ETtoday》訪問時表示，當初只是單純把自己的看法跟粉絲分享，且看法是主觀的，若在表達上讓文大人心裡受傷，向文化大學的校友致歉。他也強調，要當台大校長，需要了解台大人的學風，只有大學時期吸收台大的養分，當台大校長才有說服力。
吳嘉隆2日也在臉書上指出，他認為真正的問題在台大遴選過程出現爭議，教育部質疑是成立的，台大校園自主訴求也成立，所以形成對撞，所以問題升級成為藍綠對決的戰場。他也表示「在這個過程中，文大的人意外受傷，我是真的願意表達歉意！」
