台南市登革熱病例數持續創紀錄，包括衛生署前署長楊志良在內的公衛專家疾呼，應盡速成立中央流行疫情指揮中心，以有效調度並統籌資源，才有助於控制疫情。中央還在等什麼呢？
去年登革熱確定病例數超過一萬五千例，是歷年最嚴峻，前疾病管制局局長蘇益仁警告，當時疫情最嚴重的高雄，去年此時約有一千六百多例，而今年疫情最嚴重的台南，現已破五千例、三十一人死亡，若加上即將來臨的十月、十一月高峰期，今年恐為歷年之最。
每天增加幾百個病例，衛福部疾病管制署卻始終不願成立中央指揮中心，讓專家憂心忡忡，不惜與疾管署長郭旭崧公開槓上。蘇益仁說：「要有效防堵疫情，在疫情剛開始時就要介入，且地方人力有限也無專業人才，中央應盡速進入。」
中央神隱 楊志良疾呼
多位專家也都贊成這個觀點。前衛生署長楊志良就直說：「早就應該成立指揮中心，讓中央資源下去！」二○○九年八八風災造成高雄許多地下室淹水，就因中央及早介入，最後疫情才沒有擴大。
疾管局前局長、嘉義市市長涂醒哲也認為，中央有流行病學、防疫、蚊子等各領域專家，病例數未上千時就應介入，放著專家在台北，對疫情控制沒幫助。
參與多次防疫的台大預防醫學研究所教授金傳春指出，登革熱病例出現前五十到一百例時，就要繃緊神經，現在台南防疫人員已無時間做協助疫情控制的疫調，應由中央調度各縣市與各大學人力投入。
等不到中央成立指揮中心，台南市政府九月七日成立專家顧問小組，由蘇益仁擔任總顧問，當晚疾管署發布新聞稿，指郭旭崧進駐台南，成立前進指揮所支援地方政府。
熟知疫情處理的人士一語道破：「政治是微妙的。」進駐台南，表示疾管署資源進駐，但這只在疾管署層級。若成立中央級的指揮中心，是拉高到行政院層級，可以指揮環保署、國防部、教育部等部會，更能有效率防疫，但最後成敗責任就在疾管署與行政院。
疾管署副署長莊人祥表示，登革熱是環境病，地方政府有相關防治機制可以調動，疾管署也會盡全力幫忙。衛福部次長林奏延表示，接下來若另一個縣市發生大流行，就一定要成立中央指揮中心。
登革熱是嚴重會致死的傳染病，透過病媒蚊擴散後就全民遭殃，當地方人力有限時，資源充沛的中央單位全力介入，刻不容緩。
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