特偵組偵辦二次金改弊案的對象，終於輪到吳東亮了！根據曾經看過特偵組起訴卷宗的人士表示，他們早在這些卷宗裡看到吳東亮的名字，也看到特偵組在追問吳東亮和陳水扁之間的金錢關係。
據特偵組掌握的證據，當年財政部與金管會有官員為特定人士「量身訂做」與「事後護航」，恐怕是讓吳東亮能「信心十足」，提筆寫下足足溢價四成的二十六．一二元的關鍵原因。
二月五日調查局北機組、台北地檢署及檢察事務官對台新金等十一個地點進行搜索，並傳訊吳東亮等人，吳東亮本人當晚經特偵組檢察官訊問後飭回。
標案疑量身訂做
不過，最高法院檢察署在搜索行動結束後，卻罕見地發布一則「描述甚詳」的新聞稿：「本案係本署發現陳前總統水扁等人，於○四、○五年間推動二次金融改革政策時，台新金控於○五年七月間，轉投資彰化銀行發行之十四億股特別股，成功入主彰化銀行成為最大股東，事後並繼續推動合併事宜，相關過程疑涉有不法情事。本署特別偵查組及台北地檢署經過濾相關卷證及約談相關人後，認非執行搜索，恐難進一步取得相關事證，經向台灣台北地方法院聲請搜索票獲准後，發動此次搜索行動。」這則新聞稿正式宣告：吳東亮的麻煩大了！
吳東亮這次惹上的是什麼樣的大麻煩？這一切都是從政治獻金開始。因為特偵組懷疑，除了國泰蔡家之外，吳東亮恐怕是扁家另一部「提款機」。
根據特偵組調查，吳東亮錢進陳水扁或扁家的紀錄頻繁，最後一次的金錢關係疑似發生在○八年、民進黨推出謝長廷為候選人的總統大選期間，陳水扁派人去向吳東亮「募款」二千萬元。
為了查證陳水扁是否收到這二千萬元，特偵組去年底還約談多位陳水扁在總統府的幕僚，但熟悉民進黨募款人士卻指出：「謝長廷只在高雄市長選舉收過陳水扁的贊助款，但○八年總統大選競選期間沒聽過謝長廷曾收過陳水扁的贊助款。」
民進黨內當時多半知道，謝長廷在○八年總統大選競選期間並未委託陳水扁進行募款，當時謝系還曾抱怨總統大選的募款不順利，能捐款上千萬元的支持者並不多，導致謝長廷在全台各地競選分部的活動經費常常捉襟見肘。因此陳水扁當時向吳東亮「募款」二千萬元的理由與最後的去向，仍待特偵組調查。
此外，同時吳東亮也承認曾在○四年總統大選期間，提供扁家五千萬元的政治獻金；至於扁嫂吳淑珍則承認曾收到吳東亮一億元，放在國泰世華保管室內。不過特偵組另有消息，指當時國泰世華保管室內，有一筆「超過」一億元的新鈔，上面綁有「台新銀行」字樣的綁鈔紙帶，這筆錢是否又是另一筆追查之外的獻金？仍是特偵組追查的重點。
不過，不管是二千萬元、五千萬元、一億元或是更多，一年來，特偵組至少確定吳東亮和陳水扁之間是有多次的金錢關係，於是調查對價關係，就成了特偵組五日搜索台新金控的重點。
特偵組承認搜索行動與台新金控併彰銀案有關。據了解，一年來，特偵組發現，財政部對彰銀案採「賣掉經營權，卻不賣公股股票」，財政部釋股政策與目的，究竟是為誰、為何釋股？
當時在財政部國庫署的主導下，決定以彰銀發行十四億股特別股引進新資金，改善彰銀的財務。但是特偵組發現，彰銀這十四億股特別股真的「很特別」。
根據有關單位的解讀，認為彰銀特別股的特別之處，包括：一、享有董事投票權與被選舉權；二、特別股不上市掛牌交易（如此即無市價，得標人不必提列投資備抵損失）；三、以發行價十七．九八元作為發放股息計算基礎（一般都以十元票面作為計算基礎），此舉可減輕得標人的成本負擔；四、三年強制轉換為普通股。
金管會疑事後護航
同時財政部還在投標前加碼承諾，一、先讓兩席董事給得標人，以保障得標人權益；二、彰增資後將協助得標人取得過半數的彰銀董事席次；三、得標人享有彰銀公股優先承購權；四、透過公開市場釋出彰銀公股，避免製造第二大股東。當時財政部政策不斷幫彰銀案搽脂抹粉，當年參加投標的兆豐金董事長鄭深池，甚至對特偵組說，「兆豐金是奉命投標！」兆豐金的加入剛好湊足三家競標，避免彰銀案流標。
鄭深池證詞讓調查方向也因此轉向，當年財政部與金管會有官員為特定人士「量身訂做」與「事後護航」？
特偵組所謂的「量身訂做」指的是發行條件與加碼承諾，至於「事後護航」則是金管會在核准過程的審查，以及台新金控的籌資過程。當時台新金控靠發行特別股籌資三六五億餘元，買下彰銀十四億股的特別股，但其中公股金融機構就買進台新金控特別股達近六十億元，至於新橋資本（目前為台新金控最大股東）則以入股台新金控等方式出資二七○億元，有趣的是，新橋入股台新金控的資本主要來自兆豐金的聯貸案，當特偵組看到兆豐金又有參與角色時，對台新金控併彰銀案的疑慮就更多，而吳東亮的麻煩也就越來越大了！
