新政府上任剛滿兩個月，六十天不到，新內閣的屁股還沒坐熱，但是唐飛內閣一周內已經連續兩次提倒閣：一次是陳水扁，一次是民進黨立院黨團，創下了「自家人倒自家人內閣」的奇怪景象。民進黨連提兩次倒閣，不是對唐飛不滿，而是想挫挫國民黨的國會盛氣。但是，執政黨動輒以倒閣威脅在野黨，雖然喝住了在野黨「聯合政府」的奢想；但是對於脆弱的唐內閣，陳水扁的「無影掌」何嘗不是力道強勁的內傷？
陳水扁一眼看穿國民黨罩門
眼見新政府在國會中節節敗退，在國會中居優勢的國民黨馬上由「蠶食」到「鯨吞」階段，立法院院長王金平先是痛批陳水扁標榜的「全民政府」是「無能政」，並放出「聯合政府」的訊息，而國民黨主席連戰更是擺明著說依照法國雙首長制的精神，應該讓國會居多數黨來組閣，顯然，國民黨不但要聯合政府，而且還是經過國民黨主導的內閣。
「選輸的政黨來組閣」？這種話，聽在陳水扁耳中當然非常刺耳，好不容易打下的江山，卻要拱手讓人？曾經在組閣期間罵國民黨「整碗捧去」的陳水扁藉由民進黨全代會時公開向國民黨宣戰，指新政府受制舊國會，在現行憲政體制下，如果國會對新政府不滿，可以透過倒閣，讓總統解散國會，立委重新改選。
陳水扁看準了國民黨不敢提前改選的弱點，公開下戰書，果然，國民黨文工會主任胡志強悻悻的說，國民黨沒有要組聯合政府的打算，而原本態度強硬的立法院長王金平則是說，唐飛院長做得很好，沒有倒閣的必要。國民黨緊咬雙首長制的混亂設計，利用國會多數，說是「內閣制」吃定新政府，而陳水扁也以其矛攻其盾，新總統苦無權力制衡立法院，只有透過倒閣方式，讓總統有解散國會的權力，讓行政與國會體系一切歸零，這一盤棋，大家從頭來。
唐飛注定要當總統府與立法院的夾心餅乾
對國民黨而言，現在倒閣，重新選舉，以國民黨現在的氣勢耗弱，國會一定沒辦法過半數，如果立法院再輸了，等同放棄了國民黨最後的戰場，國民黨從頭到尾就是徹徹底底的在野黨，提早一年半終結國民黨的政治生命。因此，雖然被陳水扁以新舊民意的「激將法」相逼，國民黨仍不願就倒閣問題鬆口，以免引來解散國會，自絕生路。
國民黨希望在一年半時間內，以立法院的優勢對新政府下馬威，從法案到預算，讓新政府手忙腳亂，凸顯民進黨執政的慌亂與生澀，這時候大家才明瞭「當家才知柴米貴」，新政府愈亂，國民黨的選舉就愈有機會。
國民黨以「空間換時間」等待新政府在國會中狀況百出。而處於國會弱勢的民進黨卻只能「以時間換空間」，期待明年底的立委選舉能一舉突破半數，讓民進黨確實執政，不要成為跛腳政府。
在這一年半時間內，國民黨以逸待勞，民進黨苦撐待變，雙方都知道對方的痛腳，而夾在其中的行政院長唐飛就成了雙方過招的棋子，在明年底之前，注定要當總統府與立法院的夾心餅乾。
在選舉的壓力下，民進黨總統與國民黨立委互動永無寧日，但是新政府內最大的隱憂，不是陳水扁與立法院的過招，而是總統府與行政院之間的互動，已經出現了嚴重的「訊號微弱」現象。
陳唐體制出現裂痕
到底陳水扁與唐飛之間有沒有問題？這個問題，放在才成立兩個月的新政府身上，的確有點尷尬，尤其唐飛在總質詢期間，在立法院中被在野黨立委冷嘲熱諷指他是「總統府的幕僚長」，甚至游月霞還當場清唱「沒有了羽毛的畫眉鳥，想飛也飛不了」來消遣，唐飛的權力基礎不穩，完全要看陳水扁的眼色。
而在陳水扁以倒閣來牽制在野黨解散國會時，國民黨也見縫插針說，陳水扁想「借刀殺人」，藉由倒閣案，假戲真做幹掉唐飛。唐飛是國民黨員，與民進黨執政團隊互動溝通，原本就有先天上的困難；加上，他與陳水扁的互信基礎並不深，因此，經過連番兩次倒閣風波後，大家也可以看出，才兩個月的陳唐體制，其實已經顯露出細微的裂痕。
光不論兩次「喊假的」倒閣案，從縮短工時案、加稅案、統籌分配稅款案到高科技員工配股案，都可以看出府院之間協調失衡的狀況。從爭議最高的縮短工時案，陳水扁在工商團體的強大壓力下，要產業界自己去找立法院施壓，發出正義之聲，讓立委自己提案修法。據了解，王金平在七月十二日下午到總統府與陳水扁見面時，已經透露出立法院可能透過修法方式，制定日出條款，延到九一年實施，讓企業界有緩衝期。原因是，前陣子，王金平與游錫堃、魏起林等人參加王永慶的餐敘，王金平主動提起，應該可以透過修法，讓企業界喘口氣。
原本陷入無解的縮短工時案，在國會可能做出讓步的消息傳出後，反倒行政院方面有了意見。唐飛在報紙傳出後，反應是「是誰在放話」，「行政院不知道縮短工時案要延後」……等等狀況外的談話，搞得原本說「樂觀其成」的總統府祕書長張俊雄很尷尬，說要尊重行政院的體制，不會做個「太上行政院」。
行政院提政策先探探總統府口風
陳水扁一向善於觀察風向，調整施政角度，是典型的政治人；而唐飛則是一板一眼的軍人性格，覺得體制至上，凡事按部就班，不諳官場運作。因此，原本在國會中可以順水推舟的縮短工時延後案，因為行政院的態度消極，因此立法院也只好暫時卡住了，以免自己套上擁商的帽子。
工時案，府院步調不一，高科技員工配股按實價課稅，陳水扁一句「員工配股不課稅」，也讓好不容易逮到一隻「肥羊」的財政部為之氣結，財政部長許嘉棟只好說，依照稅法上的「事實」，財政部是可以課稅的，不過，要等配套措施出來後，才會對高科技員工配股課稅。這已經是繼加稅風波後，陳水扁第二次潑財政部冷水，也難怪財經部會每次提出新構想，都得先探探總統府的口風。
工時案，立法院想翻案，直接找上總統府，而高科技員工配股課稅案，陳水扁的一句話打翻了財政部一缸子的計畫，雖然唐飛是閣揆，但是不管是立委或是閣員，大家任何動作前，都得先去問問陳水扁，好像忘了還有一個「唐院長」。
以前，在李登輝時代，蕭萬長也面臨這種尷尬，但是唐飛與蕭萬長不同的是，蕭萬長是李登輝一手提攜的國民黨新生代，對李登輝有一定的依賴，但是唐飛與陳水扁卻是毫無淵源的臨時搭檔，像是結婚後再談戀愛的相親夥伴，共同持家，須要透過摸索與適應。只不過，以目前國會險惡的局勢，加上陳水扁事事都管的強勢風格，唐飛能否撐到明年底？恐怕連他自己都沒把握。
