北農群聚感染風波持續延燒，為了遏止疫情持續、感染範圍擴大，經中央流行疫情指揮中心與雙北市府討論後，正式於6月24日成立專案小組。
指揮中心加強3大措施，包括台北市第一果菜批發市場和環南市場須進行全員採檢等。
由於北農群聚事件尚未平息，指揮官陳時中今（25）日於記者會上宣布，為了協助地方政府，指揮中心成立專案小組，經初步調查，台北第一果菜批發市場及環南市場持續有確診個案，擔憂有偽陰性問題，盡速完成PCR核酸檢測，全力防堵疫情，上述為第一項措施。
農委會主委陳吉仲補充，自6月20日起進行員工、承銷人及相關作業人員廣篩。截至昨為止，北農共5022人篩檢，PCR陽性15人；新北3626人，全為陰性。
第二項措施為，落實相關接觸者疫調；第三則是針對相關攤商停止營業清消三天有停業的確診及周遭往來密切接觸者，盡速匡列並採檢隔離。
此外，自6月24日起台北第一果菜批發市場及環南市場的員工、承銷人、作業人員等必須持檢驗陰性證明才能進入市場，且要求這2處果菜批發市場的工作人員進行健康監測並每天回報。
陳吉仲指出，擔心農產品都是從中南部運上來，2家果菜批發公司總經理已進行4個市場的全部盤點，所有運農產品司機跟司機的隨車人員共1570人，已透過各縣市政府開設的快篩站，讓司機跟隨車人員全部篩檢，下周二（6/29）起要全部持陰性證明才能進市場。
針對市場群聚部分，陳吉仲說明可以看出周遭外圍有4個群聚點，顯然不是單一區域發生，是有幾個散發區域，必須要做系統性的採檢，要展開系統性PCR採檢，檢驗出來就要持續匡列熱區，進行疫調，再進行一圈圈隔離，才能清零。
從確診地圖分布來看，第一果菜批發市場是在中間的位置，藍色圓點為確診人數，紅色是市場入口，中間批發市場沒有確診個案，都是周遭都是在零批市場。
陳吉仲表示，接下來將透過防疫要求，針對所有零批市場做好所有防疫，包含確診單位不能營運，周圍攤位也要做好疫調隔離、匡列等。
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