到了現任市長柯文哲任內，洪致文不顧當時台灣興起「白色力量」，毫無避諱地批柯市府的西區門戶計畫是「設計師的浪漫」與「偽文青的想像」，使洪與其他文史團體遭柯文哲戲謔為「文化恐怖份子」。
洪致文近年所發動的最強大「恐怖攻擊」，是針對亦敵亦友的台鐵局。他在著作《像我們這樣的文化恐怖份子》中感嘆：「這一役非常辛苦，是鐵道文化資產保存上最艱辛的一次。」他口中的戰役，就是他爭取後留下的這片土地：「台北機廠（北廠）」。
爭取台北機廠「存活」 炮轟政府「賣祖產補虧損」
一九三五年啟用、占地近十七公頃的台北機廠，位於松山文創園區與京華城之間的精華地段，是台灣規模最完整的鐵路車輛修理工廠，見證台灣鐵道發展史，但台鐵二○一二年將維修廠遷至桃園楊梅富岡基地後，北廠這塊「金雞母」，被台北市政府與台鐵局規畫開發為商辦、住宅。
眼看北廠即將被政府「瓜分」，著有逾二十本鐵道研究書籍的洪致文，自然難以接受，靠著長期研究的知識，不斷奔走於文資、都審等會議中；他甚至還曾炮轟，政府賣文化資產補貼台鐵虧損的政策是「賣祖產的不肖子孫行為」，字字句句都毫不留情。洪致文的「恐怖行徑」引起公民團體關注，再加上管碧玲與時任立委的文化部長鄭麗君大力聲援，逼得文化部在一五年三月十五日召開國定古蹟審查，十四名審議委員一致同意，將北廠全區列為國定古蹟保留。
一路走來，身處體制外的「師範大學地理系洪教授」一向炮火猛烈，被官方視為頭痛人物。但也因為他長期對文資的堅持與執著，一七年文化部進駐台北機廠時，立刻找上洪致文討論，如何運用這項文化資產，並達成設立鐵道博物館的共識；今年八月十三日，行政院核定設立鐵道博物館籌備處時，洪致文理所當然成為鄭麗君第一個想到的主任人選。
接獲徵詢當下，洪致文不禁自問：「我向來在民間發聲，進入籌備處得管理這麼大的計畫，做得來嗎？」但這個問題沒有困擾他太久，他認為，自己長期參與北廠保存、研究，了解博物館未來發展方向，應不會慌了手腳，因此九月十七日在臉書上宣布，他將「承擔這個許許多多人曾經努力與倡議數十年，建構台灣鐵道博物館的重任。」
雖然洪致文接掌的是數十年來全心投入的領域，但從體制外的「恐怖份子」轉進體制內，甚至還得和自己過去撰文痛批的政府官員攜手合作，執行保存車輛、規畫鐵道展覽等業務，角色如何轉換調適，成了他不得不面對的課題。與洪致文「交手」超過二十載的台鐵機務處處長宋鴻康就認為，洪致文忽然從「在野黨」變成「執政黨」，未來勢必會比較辛苦。
「我好像不是體制內，也非體制外的人，我現在進行的任務，就是這幾十年來做的事啊！」布達儀式隔日，洪致文在同一地點接受《今周刊》專訪，脫掉西裝、身著工作服的他，完全擺脫了前一天的緊張尷尬，對於身分轉換，顯得老神在在。
但笑望碩大廠區的洪致文，回憶過去幾年的衝撞，從起初不知能否救回這座古蹟，到能在二○二六年將北廠轉型成為國家鐵道博物館，仍覺得一切有些不真實：「我從沒想過有這天，我們以為有個地方擺放火車一、二十年就不錯了，怎麼敢想到有機會成立鐵道博物館。」
但回到現實，洪致文聊起如何打造他理想中的「活的博物館」時，幾乎不需要草稿，畢竟這些想法，早已深深埋藏在他腦海中數十年。
記者安排他在組立工廠拍照時，日本的臥鋪列車車廂、被稱為「藍寶寶」的柴油客車，靜靜地坐落於廠中，廠內的油漬、器具依舊，彷彿時空凍結，不少人希望就此保留原貌，他搖搖頭地說：「這不是我想要的氛圍，我希望它們不是標本。」
打造「活的博物館」 「被觀看者」也是「目視者」
洪致文環視廠房解釋，火車不僅是「被觀看者」，也是連結線型空間的「目視者」，既是活歷史，就需動態展示、會說故事。「你看這幾台藍寶寶，流線型外觀可展現三○年代的設計思潮，二戰後又被配合克難運動變成『克難號』；一九五六年後又轉型為『飛快車』，車上的『飛快車小姐』成為女性在鐵道職場的代表。」
- 克難運動：1950年，台灣面臨風雨飄搖，政府發起「克難運動」，讓社會充滿克難、簡樸風氣，一切從簡、度過難關。
洪致文比手畫腳，強調一輛車可講設計、歷史、女性勞動史，展區只需每幾個月更換主題，就可說不同的故事、吸引民眾、穩定收入。「這是台北機廠誘人之處，不像國外只是擺一堆火車的常設展，不是『木乃伊火車』。」他閃爍著期待的眼神，此刻的他不是「籌備處主任」，反像是純粹熱愛鐵道、到處追火車的男孩。
儘管擁有豐富的鐵道知識與滿腔理想，但一起推動鐵道古蹟保存的文化部主任祕書陳登欽，談到「執著」的洪致文，嚴肅地說，洪致文如何在博物館內把歷史講得有趣，讓一般民眾接受是項大挑戰，「他需把高度知識落到凡間。」
但○二年就認識洪致文、現為《鐵道情報》總編輯的打狗鐵道故事館館長古庭維認為，洪致文了解全台的文化資產，也長期與台鐵合作，即使籌設博物館得和各方人士打交道，還需緊盯計畫進度，「但他長期嚴謹考據鐵道文史，加上抗壓性高，即使挑戰很大，也能沉穩面對。」
就像他在布達儀式宣示：「我相信，只要我們走在正確的軌道上，國家鐵道博物館這班列車的汽笛，一定很快會響起。」早在這條路線上從未離開的洪致文，才正帶領籌備處「空窿、空窿」地駛進名為「國家鐵道博物館」的那一站。
▲鐵道博物館籌備處主任洪致文（中）做出鐵道人員「指差確認」手勢，宣告籌備處正式啟動。
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