南北葉門統一後，仍由薩利赫掌權，只是統一後不過4年，南方勢力又鬧獨立， 同樣的勢力2007年再度崛起。在2009年，激進的「蓋達」組織轄下蓋達組織阿拉伯半島分支（AQAP），和其羽翼伊斯蘭教法虔信者（Ansar al-Sharia），在南部和東部各據一隅。割據北方的胡塞（Houthis）組織，自2004年到2010年間，曾六度反抗薩利赫政府。
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2000年，AQAP對停靠葉門亞丁港的一艘美國海軍驅逐艦「柯爾號」（USS Cole）發動自殺炸彈攻擊，17名美軍喪生。2001年9月11日，紐約又發生舉世震驚的九一一事件，蓋達組織宣稱是他們所為。從此，對付蓋達組織及其附屬勢力的跨國反恐合作，成為華府區域安全的首要考量。薩利赫也立即表態宣布支持布希總統的反恐戰爭，美國軍援於是源源而至，據統計，美國向葉門提供超過8.5億美元的軍事援助。
2011年，阿拉伯世界掀起「阿拉伯之春」的革命浪潮，葉門人民不滿專制腐敗的薩利赫政府，敵對陣營也試圖拉薩利赫下台。
迫於國內外壓力，薩利赫2012年選擇退位，交換不被起訴的保證。哈迪（Abd-Rabbu Mansour Hadi）靠海灣阿拉伯國家合作委員會（GCC）和美國的支持上位，成為臨時總統，在聯合國協調之下，邀集國內各派系代表草擬新憲法，但各方權力分配談不攏，至終未能達成協議。
不料，官方調漲油價的政策，竟引發持續至今的全面內戰。2014年，哈廸政府為爭取國際貨幣基金（IMF）5.5億美元貸款，宣布取消燃油補貼，作為經濟改革的一環。胡塞組織發動要求調降油價並另組新政府的大規模示威，哈迪的支持者和隸屬穆斯林兄弟會（Muslim Brotherhood）一支的伊斯蘭黨（al-Islah）也發動反示威。2014年末，胡塞組織攻陷首都沙那的大部地區，並繼續向南進軍。哈迪政府在2015年1月被迫辭職，流亡沙國。
葉門內戰不斷 變成阿拉伯世界派別代理人戰爭
葉門這些年來分為兩股敵對勢力，胡塞組織和原本忠於薩利赫的部隊結盟，也因此在戰場上頗有斬獲。其他民兵組織則對抗胡塞組織和薩利赫勢力，和仍忠於哈迪政府的部隊結盟。其間，沙國也介入葉門的內戰，派出空軍轟炸沙那，試圖幫助哈廸政府奪回對沙那的控制權。
胡塞組織崛起於1980年代末期，以復興宰德派（Zaydi）什葉派的宗教和文化為訴求，在遜尼派為主的葉門境內算是少數。2003年後，胡塞組織積極投入政治，因薩利赫支持美國入侵伊拉克而與薩利赫政府決裂，薩利赫辭去總統後又和他結盟。雙方其實貌合神離，只因為他們都反對為國際所承認的哈迪政府。薩利赫影響力仍在，有一部政府軍、部族和政治團體效忠於他。但在2017年，當薩利赫表態願和沙國為首的聯盟對話，最後卻被胡塞組織所殺，忠於薩利赫的部隊也遭逐出沙那。
葉門內戰也逐漸演變成一場阿拉伯世界兩大派別的代理人戰爭。胡塞組織有伊朗軍事上的支持，雙方教義不同但同屬什葉派，和黎巴嫩同屬什葉派的真主黨也有聯繫。據有南方的合法政府則有遜尼派為主的阿拉伯國家支持，還曾在2015年，應哈廸所請組多國聯軍進入葉門，對抗胡塞勢力。
胡塞武力壯盛 去年11月來已攻擊29艘商船
如今，從胡塞組織對紅海發動的攻擊來看，多年來靠伊朗給養，這個準軍事組織已壯大為一支彈藥充足、火力強大的武裝力量。2023年11月以來，胡塞組織已朝至少對29艘商船，發射逾100架無人機和彈道飛彈。
胡塞組織干擾了全世界海運大約12%貿易量，迫使貨櫃輪在內的商船遠繞南非，耽誤從亞洲到歐洲的交運時間。
美國多次警告無效後，1月11日起開始還以顏色， 摧毀胡塞組織設有飛彈、雷達和無人機的設施。截至2月4日，美、英聯軍已發動三波轟炸。
2024年1月12日的一次攻擊中，沙那機場包括雷達站的設施遭到摧毀。當年為F-5戰機中隊和大漠中隊特設的基地不知如今安在？碩果僅存的那架F-5E戰機也不知情況如何？在美軍看來，這架算算已服役45年經典（vintage）戰機並無戰力，不妨留下，當作是台（中華民國）、美、沙曾經在阿拉伯半島的歷史見證。
中華民國空軍飛行員1980年代曾駕著葉門空軍的F-5E戰機，遨翔於阿拉伯半島的天空。
