國民黨台北市議員張斯綱、桃園市議員凌濤以及發言人楊智伃在2022年9月召開記者會，質疑陳吉仲過去科技部補助專題計畫涉及抄襲，還指陳吉仲是「抄襲慣犯」、「一魚兩吃」等語。同年10月，陳吉仲對張斯綱等3人提告加重誹謗。
台北地方法院周一(1/15) 認定張斯綱、凌濤、楊智伃均犯散布文字誹謗罪，分別判拘役50日、55日、50日，分別得易科罰金5萬元、5萬5千元、5萬元，全案可上訴。
對此，陳吉仲在臉書表示「公道終還」，奉勸政治人物不要再操作學術論文，學術論文的問題就該回到學術界來檢視與處理。
而張斯綱3人發出共同聲明表示，因目前尚未收到判決書尚無從知悉法院認定的詳細原因，惟3人對於法院判決結果深感遺憾，3人於記者會上所為言論均秉事實說話，且陳吉仲先生當時貴為農委會主委掌管國家農業發展方向，其言行與計畫承攬本應受社會大眾與民意代表檢驗，誠屬民主政治中的常態。
其次，民主多元社會本應容許各種價值判斷，由言論之自由市場機制，使真理愈辯愈明，以避免人民因恐有侵害名譽之虞，無法暢所欲言或提供一般民眾亟欲瞭解或參與之相關資訊。今日該判決成立，將嚴重衝擊當權人士被公眾檢驗的力量。
因此除了對判決感到遺憾之外，3人後續也將上訴爭取司法公道、捍衛民主政治常規，更期待二審法院將會作出公正判決、伸張正義。
以下為陳吉仲臉書發文全文：
勝訴了！前年縣市首長選舉時，國民黨許多政治人物為了選舉與政治操作，刻意攻擊我過去曾參與過的計畫案。不實指控我抄襲，甚至開記者會以許多不堪的字眼惡意攻擊我。為了捍衛自己的學術聲譽與清白，我向他們提起訴訟。經過法院一年多的審理，今天法院宣判 張斯綱、凌濤、楊智伃 等，犯刑法散布文字誹謗罪，處拘役50日不等。公道終還。
這些人不了解什麼是紮實的學術研究，恐怕也不知道我不只發表國內學術期刊，還發表多篇包括 SCI 級的國外學術期刊。無論計量模型或數學規劃模型，都是自己寫程式來跑實證研究。我是農家子弟，農家精神就是勤奮踏實、克服困難，田裡才會有好收成。這是我自己的生命經驗，也是我的價值觀，我也同樣以農家精神來要求我自己的學術工作，必須要有一定的水準。我也為此自豪。
因此，面對這些人為了個人政治利益而惡意攻擊指控抄襲，我當然要站出來捍衛自己的學術聲譽。今天法院判決，只是還給自己最基本的公道，但卻已無法還回當初被污衊的聲譽。就如同 Linbay好油林裕紘及國民黨工許哲賓用不實的網路攻擊被起訴一樣，真相終會大白，但當初的紛擾及造成的傷害卻是無法禰補。
惡意的政治操弄或許能換來個人一時流量，但卻是以傷害學術研究及公共利益作為代價。奉勸政治人物不要再操作學術論文，學術論文的問題就該回到學術界來檢視與處理。
