針對媒體以「南海工作會議紀錄全文」稱美國施壓臺灣研製生物戰劑一事，總統府在7/12發出新聞稿，發言人林聿禪表示，連日來包括總統府、國防部及蘇貞昌前院長等已接連多次陳明，我國不會也沒有發展生物戰劑的計畫。
而後該媒體記者被控偽造文書等罪，週二(9/5)台北地檢署認定「南海工作會議紀錄」是造假。
不起訴書上點出，會議記錄格式與「行政院院本部形制規範作業規範」專案會議紀錄格式不符，文字運用均非國軍常用軍語，且國軍落實行政中立多年，不會如使用「本黨」做發言詞。
北檢表示，該記者僅向國防部軍事發言人查證，卻未進一步向召開會議的行政院查證，因此報導前查證尚有疏漏。不過，難認定主觀上有偽造文書犯意，因此將該記者不起訴。
(原文刊載於2023/7/12，更新時間為2023/9/5)
早前林聿禪說經過查證，這件所謂的「南海工作會議紀錄全文」內容破綻百出，除了事實上根本沒有這項會議外，文件格式也非政院會議慣用格式，多處用字遣詞更非我國常用，相關樣態與近期中國透過造假公文書操弄假訊息的模式若合符節。
國防部亦表示，報導所謂之「會議紀錄」引用國防部發言使用「坦克」「各軍總部」等軍語失當，內容拼湊且缺乏連貫性，語法類似偽造之錯假訊息、顯非事實。
國防部說明，聯合報前以「依美方要求我國研發生物戰劑，規劃設置新建生物安全第四等級實驗室(P4)，本部已完成規劃」之「會議紀錄」查證時，國防部即明確指出，軍醫局預醫所以執行傳染性疾病之病原的偵檢、防護及治療任務為主。
同時研發生物戰劑之偵檢試劑，以強化防衛性生物戰劑偵檢能力。另第四級實驗室則主要針對傳染性疾病之病原進行偵測、防護及治療為主，刻正規劃建置符合生物安全之研發處所。有關「美國疑敦促我研發戰劑」「由美方協助規劃審查」之傳聞均非事實。
國防部進一步指出，該報公布之完整「會議紀錄」，有關「國防部發言」內容更存多項謬誤，使用「坦克」「各軍總部」「軍火採購」等均非國軍常用軍語；國軍落實行政中立多年，普受各方肯定，更不會如同共軍般，使用「本黨」做發言詞。
以此種「紀錄」做為新聞報導佐證，既不符媒體客觀公正之社會期待，更戕害國軍形象，應即為更正。
總統府發言人林聿禪則是表示，聯合報不僅遲未刊出相關澄清，更以捏造文件繼續不實報導，無視可能陷國家形象與國民利益受到損害，令人憤怒。總統府再次呼籲應該立即更正，並向國人表達歉意。
林聿禪說經過查證，這件所謂的「南海工作會議紀錄全文」內容破綻百出，除了事實上根本沒有這項會議外，文件格式也非政院會議慣用格式，多處用字遣詞更非我國常用，相關樣態與近期中國透過造假公文書操弄假訊息的模式若合符節。
「尤其過去兩年北京也屢以指控他國發展生物戰劑操弄國際輿論，這次的操作更顯疑點重重」。
另外，媒體稱總統府在第一時間未回應，林聿禪還原當日聯繫情形：記者於11:38以文字訊息詢問回應，因提問內容及資訊並不完整，林聿禪便於11:41回覆「我先了解一下」以進行相關資訊確認。
「未料聯合報未待我方回應查證結果，於不到20分鐘的時間，12點整即發布該篇新聞，稱有進行查證的說法並不誠實，且事後於總統府發出聲明駁斥不實後，也遲未刊登。
林聿禪強調，臺灣是民主國家，保障言論及新聞自由，但絕不能容忍錯假訊息散布。
對於媒體連日無端指控，林聿禪說，已經損及國民與國家的利益，更是對區域穩定的惡意挑弄，非常不負責任，再次呼籲慎重看待自身社會責任，即刻並且勇敢的面對錯誤，更正這項不實報導。
