今年端午節連假，交通部針對全國陸運交通疏運，係以防疫為首要。國道採高強度之車流調控與匝道管制，延長儀控紅燈秒數、採單一費率（無每日20公里優惠里程），並關閉服務區賣場，僅保留部分公廁、加油站服務；雙鐵及國道客運每個車廂乘載率控制在兩成以下，同時要求各疏運單位確實執行場站運具之清消作業、量測體溫、強制配戴口罩、進出實聯制等工作。然而，超嚴管制卻讓國道一度大塞車，貨車司機抱怨「快崩潰了」，塞在高速公路上，車程多了整整一倍。
端午節連假首日（6/12），國道全線交通量為52.0百萬車公里，較去（109）年端午節連假首日119.8百萬車公里減少56.6%，150公里以上長途旅次車輛數較去年端午節連假亦減少65%（減少13.2萬輛），其中以小客車為主之國5南向通過雪山隧道交通量亦較去年端午節連假首日減少3.2萬輛次約減少66%，顯見嚴格匝道儀控管制有抑制150公里以上跨區活動旅次及使用國道的車輛數。
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基於今天早上國道全線交通量比昨天減少三成，且預估下午大部分用路人開始北返，今日下午16:00起，國道「嚴格匝道儀控管制」調整為「連續假日匝道儀控」，即視各別路段壅塞情形實施儀控，必要時分路段實施精進式匝道儀控。
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在公共運輸部分，假期首日高鐵總計開行89班車次，總載客0.69萬人次，平均乘載率4.8%、臺鐵載客數為8,135人次，平均乘載率2.33%、國道客運，總計開行1,183班次，總載運人數4,009人次，平均乘載率10.8%，乘載率均符合期望目標，感謝國人配合。
交通部表示，本次端午節尚有1天假期，仍會持續落實各項防疫作為，並持續追蹤各疏運單位辦理情形。交通部呼籲民眾，在此疫情嚴峻時刻，遵從指揮中心指示減少不必要外出，並做好相關防疫工作，減少人群聚集，降低疫情擴散風險。
另外，針對目前執行之嚴格匝道儀控管制，高速公路局已實施匝道儀控彈性處理機制：針對民生物流及大客車較多匝道，請交控中心監控人員彈性放寬綠燈秒數，另緊急救護車輛可走匝道路肩，請等候車輛多加禮讓，高公局呼籲小車不要上國道，將國道讓給上述車輛優先行駛。
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