儘管已是在野黨，儘管場面已縮小且冷清許多，國民黨十六屆二中全會還是通過一百多位中央委員連署呼籲連戰競選總統提案，而中常委改選也仍吸引不少政、商人士爭取這塊雞肋。不過外界對於連戰搶先起跑，與誰當選中常委以及排名順序如何其實並不在乎，政壇所注意到的是，國民黨高層面對陳水扁、李登輝的泛綠聯軍固然束手無策，即使在處理泛藍陣營內部問題上，國民黨也是進退維谷，既不敢進，又不能退，處境堪憐堪憂。
連宋合作由少數人主導──國民當本土派強烈不滿
主張國親合作大抵已是國民黨不分派系的共識，連戰與宋楚瑜的互動也漸入佳境，但是由於國親合的運作幾乎都由親民黨主導，雖然宋楚瑜盡量小心地採取低姿態，希望換取國民黨人士的信任，然而宋楚瑜精於權謀算計的形象已然深入人心，宋愈是低調謙恭，愈是令國民黨方面懷疑狀況不單純，尤其連戰在黨內的領導能力本來就受到質疑，而國親合的運作又只有連戰與極少數幕僚與聞決策，其他幹部別說獻策，就連背書都苦無機會。
一位平日與連戰互動還算不錯的副主席就曾私下抱怨，「不知道連戰為什麼老是把圈圈畫得那麼小？」一般的幹部也擔心連戰與宋打交道個人吃虧事小，造成國民黨全盤皆輸事大，至於黨內本土派的不滿就更不在話下。
組發會主委陳健治不爽連戰在高雄市長人選問題上一路退讓，就相當程度反映某些國民黨幹部的情緒。這些人多半過去與李登輝關係不錯，而且對於李挺扁批連、率領台聯反噬國民黨的做法卻不以為然，可是當連戰始終無法有效改善個人與黨的形象、戰力，藍軍眼看就快變成了橘軍，這些人有的是心有未甘，有的是憂慮自己未來的政治出路，對李登輝的不滿也就相對降低，一方面泛綠陣營很大的政治操作空間，同時也讓某些人思考是否乾脆直接投向親民黨，反而有機會卡位，致使國民黨在左右兩側同時拉扯下更形脆弱。
這個現象存在已經不是一天兩天的事，而且每次遭遇重要選舉就會更為凸顯惡化。以這次高雄市長選舉為例，黨內重要幹部認為，打從四年前吳敦義敗選之後，基層與輔選系統就不斷建議，中央應該及早規畫光復高雄市的人選，然而高層遲遲未見任何行動，直到最近才鎖定黃俊英，偏偏黃的民意支持度一直沒有起色，再加上黃俊英與李登輝及台聯方面關係曖昧，黨中央既不能強勢提供黃俊英輔選資源，又不能充分信任黃的政治動向，只好任由宋楚瑜主導人選，為宋參選二○○四年大選打下一根樁。
國民黨黨工軍心浮動──優退方案讓黨工如願以償
對於高層的不作為感到灰心的國民黨幹部指出，可以想像同樣的情況到了總統大選前一定會再度上演，連戰雖然獲得中央委員連署通過參選總統，但是憑國民黨目前的情況，如何能夠形成連宋配，國民黨要如何能免於進一步邊緣化？「與其坐以待斃，不如趁早自謀生路」，已經成了許多國民黨中央與基層幹部長吁短嘆的無奈結論，而國民黨最近正辦理的黨工優退方案，則提供已有去意黨工更大的誘因，軍心浮動現象至為嚴重。
據指出，連戰非常清楚自己的處境艱困，可是現實情況使他除了選擇與宋楚瑜合作，幾乎沒有第二條路可走。
一位接近連戰的黨務主管表示，想從民進黨手裡拿回政權，北高市長之戰極為關鍵，如果藍軍在高雄市推不出夠實力的候選人，李扁率領的泛綠聯軍將可集中力量在台北市對付馬英九，就算馬英九憑著現任優勢獲勝，可能也是險勝，對藍軍挑戰二○○四大選影響甚巨。反觀只要謝長廷無法順利連任，今後一年多時間，陳水扁執政氣勢將大受挫折，兩軍一消一長，大局將出現結構性變化，國民黨人不該過於短視。
至於張博雅因為拒絕旗幟鮮明掛出藍旗的問題，國民黨高層人士認為，擔心張博雅日後可能又會倒向綠營的問題，同樣也發生在黃俊英身上。這位熟悉高雄政治生態的國民黨高幹說，挺黃最力的是高雄市前議長陳田錨，而陳田錨與李登輝的密切關係眾人皆知，所以黃俊英與台聯互動切密，如果國民黨一定要支持明知勝選機會較低的黃俊英，卻拒絕考慮民調與基層反映都認為唯一有可能擊敗謝長廷的張博雅，實在不是個聰明的政治算盤，而為了防堵宋楚瑜，寧可便宜陳水扁，更非智者所為。
雖然雙方都搬出了一套道理，但誰也說服不了誰。連戰雖然總算同意黃俊英在二中全會與馬英九同台造勢，自己面對中央委員的集體勸進，也堆起滿臉笑容，不過他對所有涉及高雄市長與總統大選的問題還是絲毫不敢鬆口，箇中委屈有的與連戰個性有關，更大一部分原因則是國民黨以及連戰個人在當前政治環境中充滿著無力與無奈，不論面對親民黨宋楚瑜或是民進黨陳水扁，都是戰不能戰，和不能和，只能靜待外在情勢決定國民黨的命運。
