在生技業風起雲湧的今天，許多傳統製藥廠都希望能搭上這班生技列車，冀望能從「藥販子」變身為「生技新貴族」，然而國內較具規模的製藥廠，成立時間平均都在三十年以上，但近年來國際環境、政府政策、合併趨勢、市場結構的改變，眾多不利藥廠經營因素紛紛浮出台面，轉型之路走得艱辛。
本土藥廠通路嚴重落後
在了解國內藥廠所面臨的競爭及該如何轉型前，先認識國內藥品通路的概況，將有助於我們更深入地探討製藥業者所面臨的危機與轉機。
據統計，在健保藥品來源中，處方頻次以本土製藥廠所生產的藥品比重最高，約五成至六成，其餘為外資來台所設之製藥廠(在台外資藥廠)及進口藥品不到五成；然而若換算成處方金額，外資藥廠所生產的產品及進口藥品就占了六、七成，這表示本土製藥廠所生產的產品單價遠低於外資藥廠的產品及進口藥品。
從國內藥品行銷通路來看，醫院使用進口藥品及外資藥廠藥品的比重逾八成左右，本土藥廠的藥品占有率不到兩成；而診所通路中本土藥廠藥品占有率即達六成以上，藥局中本土藥廠藥品占有率亦有四成以上。
由此可知，國內藥品(含本土藥廠所製藥品、外資在台設廠所製藥品、進口藥品)的行銷通路主要為醫院、診所及藥局，其中本土藥廠的行銷通路主要集中在診所及藥局，進口藥品及外資藥廠藥品則是集中在醫院。
健保局調降藥價給付及折讓基準對本土廠不利
根據統計，一九九九年醫院的藥品通路市占率就高達七二．八％，成長率也是最快速達一七．七％，而診所、藥局市占率分別僅一六．二％、一一％，醫院是藥品的最大消費市場，且未來成長性也最高。
本土藥廠藥品約占藥品市場的三分之一，主要集中在診所及藥局，在診所及藥局藥品銷售值的市占率不到三○％，加上因醫藥分業制度實際績效不彰，國內藥局並未獲取如預期般的商機，使得藥局數由一九九七年的一萬五千家，快速降至目前的八千五百家左右，藥房市場嚴重萎縮，導致藥局銷售值的成長率遠低於醫院銷售值，也間接衝擊台灣本土製藥廠的經營。在通路結構性的差異，使得本土藥廠在通路的掌握上已居劣勢。
本土製藥業除了先天上的通路劣勢外，預期加入世界貿易組織後，進口關稅將解除，進口藥品成本大降，在國人較偏好進口藥品的療效、國內醫院亦偏好國外藥品下，進口藥品將以更低的價格搶攻台灣市場，預期會有更多國際型大藥廠藥品進入台灣，先天上的通路劣勢將使台灣製藥業者的生存空間更受壓抑。可想而知在台灣入關後，國內製藥業者所面臨的競爭壓力將有增無減。
另外在八十八年開始實施的 CGMP (優良藥品製造確效；即製造藥品的人員、支援系統如水處理、空調等、儀器、設備、分析方法等均要符合規定)，預計至九十三年七月一日前完成藥品全面確效作業，預估業者須再投入千萬元來更新軟硬體設備，加上健保局將逐步調降藥價給付及折讓基準，國內製藥廠商的生存權再受威脅。
老藥廠轉往生技製藥困難重重
經營環境的惡化，已使國內製藥業者面對空前的競爭壓力，相關廠商也正站在生死存亡的關鍵轉捩點上，從目前的情況來看，國內製藥業者只有轉型才有生機及商機可言。
目前本土製藥廠，大部分都是老牌製藥廠，過去以化學製藥起家，幾十年的思模式、經營策略，使得營運上的包袱過重，能否調整心態或生產經營模式轉往生技製藥領域，仍待觀察。而若經營者沒有意識到上述因素所帶來的衝擊，積極研擬因應措施，未來營運只會雪上加霜。
為因應製藥業前所未有的衝擊，國內製藥業者因所面臨的衝擊不一，轉型速度有快有慢，轉型方向亦有所不同。
為方便評估、歸納起見，以下將從行銷通路、策略角度，將製藥廠簡單地劃分為兩大方向，即以藥房、藥局為主要行銷通路及策略的製藥廠，及以醫院、診所為主要行銷通路及策略的製藥廠。
據台灣區製藥工業同業公會統計，其會員約有三百家，目前已上市的有中化、永信、生達、葡萄王等四家，上櫃的有濟生、杏輝兩家，及已送件並預計在下半年掛牌上櫃的台灣東洋。其中中化、永信、生達、濟生、杏輝等製藥業者主要的行銷策略重心基本上是以醫院、診所為主。
以ＯＴＣ用藥為主的製藥廠轉型仍在原地踏步
至於常在電視、電台上看到或聽到諸如國安感冒、中藥糖漿(國安製藥)，斯斯系列、敏肝寧(五洲製藥)、生產痠痛藥膏(明通製藥)等，即以藥房、藥局為主要行銷通路、策略的製藥廠。
從目前各大傳統製藥業者來看，以醫院、診所為主要行銷通路、策略的製藥廠，如中化、永信、生達、杏輝、台灣東洋等轉型動作最快且積極， 傳統以 OTC 用藥為主的製藥廠目前仍在原地踏步。生物技術開發中心郭書祥博士表示，以藥房、藥局為主要行銷通路、策略的製藥廠在該單位所舉辦的生技製藥研討會中，鮮少有他們的影子出現，公司是否有企圖心轉型可見一斑。
另外會造成以藥房、藥局為主要行銷通路、策略的製藥廠轉型動作不積極的原因是，製藥業者有一個共通特點，那就是管銷費用都很高，但其中內容卻大不同，以藥房、藥局為主要行銷通路、策略的製藥廠，錢都花在行銷廣告費用上。
而以醫院、診所為主要行銷通路、策略的製藥廠的研發管理費用不低，而這也是以藥房、藥局為主要行銷通路、策略的製藥廠，遲遲無法明顯轉型的主因，因此在加入世界貿易組織或在 CGMP 制度實施下，他們所面臨的衝擊將是最大。
老藥新用途找到新金礦
至於近幾年才成立的製藥廠普遍直接切入生技製藥或是新藥研發領域，如健亞、聯亞、華健、懷特等，其所面臨到的內外環境變遷所帶來的衝擊，則較上述兩種形式製藥廠小。
至於要如何轉型才能化危機為轉機，並看得到生機及商機？從目前國際製藥產業的趨勢、部分老製藥廠轉型方向及新成立製藥廠的布局領域等應可看出端倪。例如：
一、新藥研發：在生技製藥領域中，新藥研發商機最大，一般人對於須投入十幾二十年的時間、耗費數十到數百億元不等的資金，還不見得能成功開發出新藥，台灣製藥業因規模小、研發能力不足，根本無法勝任，但隨著「生物晶片」及「生物資訊」發展漸趨成熟及基因逐漸完成定序，專業分工將成趨勢下，勢必要有所改觀。
況且所謂開發新藥，除了純粹針對尚無藥物可治療的疾病所研發的新藥外，還包括老藥新用、新劑型開發，都泛指在廣義的新藥研發領域中。目前風靡全球為不舉男士帶來無限「生」機且更為輝瑞藥廠帶來龐大商機的藍色小藥丸──威而，原先是心臟動脈血管擴張劑，但因其對性機能障礙有著特殊的藥理反應，最後才開發出來，是標準的老藥新用途。
合併整合才能增強競爭力
另外， 美國醫學學會期刊在五月初公布的一項研究報告顯示，一種名為「 Evra」的新型避孕貼布正由美國食品暨藥物管理局( FDA )審核中， 效果及安全性與口服避孕藥相較絲毫不遜色，一旦上市亦具革命性影響，而這是屬於新劑型的開發。
相較純新藥開發，老藥新用途、新劑型開發，在時間及資金限制上，相對更適合台灣廠商發展。目前國內在新劑型開發上，如華健、信東化學表現相當積極，至於台灣東洋走老藥新用途的癌症藥物研發已頗有成果，今年剛上市可同時治療大腸癌、直腸癌、胃癌及乳癌的四合一新藥即屬此類。
二、合併、整合：合併是全球醫藥業所面臨的大變革，台灣藥品市場有限、業者規模小、研發能力相對不足，為因應未來合併洪流所帶來的衝擊，合併、整合將是趨勢所在，政府也鼓勵本土藥廠來進行合併。
其實早在一九八○年代初期，國際間就已經有人預測，合併、購併、資產重組是製藥者適應新技術唯一可走的一條路。一九九○年後期這個預言似乎慢慢得到印證。一九九八年歐洲發生了三起重大的合併案，一是法國賽諾菲與和成實驗室、二是英國的捷利康( Zeneca )與瑞典阿斯特拉( Astra )、 三是德國的赫司特與法國的羅納─普朗克。
最近一年來的合併案又有輝瑞( Pfizer Inc )與華納蘭懋( Warner-Lambert)、 英國製藥業兩大公司葛蘭素威康( Glaxo-Wellcome )和史克美占公司(Smith Kline )，其中葛蘭素威康和史克美占合併後，已成為全球最大的醫藥集團。由其背後的合併原因來看，製藥者的購併、合併、結盟等動作，除了為擴展產品的市占率外，也是為未來藥廠求生存做準備。
不少藥廠已有ＣＭＯ影子
國內製藥廠因經營成本提高，獲利遭到壓縮，小廠將會被迫退出市場，因此合併、產業整合、大者恆大、更專業是未來的趨勢，且已普遍是國內製藥業者有志一同的看法。目前市場秩序雖然較亂，而製藥廠家數也已大幅減少到二百至三百間，且預料在合併、整合或是關廠的效應下，還有再縮減一半的空間，經過留強汰弱後，長期來看對台灣製藥業的環境還是較具正面。
而從目前情況來看，在合併、整合(水平整合、垂直整合)動作上，以醫院、診所為主要行銷通路、策略的製藥廠最為積極，中化、永信、生達因是最下游的製藥、製劑業，為朝上游整合，分別成立有中國化學合成、永日、生展等。聯亞近期也剛宣布購併葛蘭素威康在台灣的新竹藥廠，另與產、學界有聯盟動作的製藥廠亦不勝枚舉。
三、藥品委託生產 CMO：國際級的大藥廠在合併後，為強化競爭力、節省研發、生產、製造費用，藥品委外代工生產未來將成趨勢。生物開發技術中心副管理師朱兆文在二○○一年我國產業生命力之新契機研討會中就指出，國際藥廠為加速新藥研發後藥品上市的速度，會逐漸將研發及生產作業委由其他專業公司進行。
在製造業慢慢走向專業分工態勢下， 這種接受藥品委託生產機構(俗稱 CMO )的興起，加上隨著外資在台所設藥廠陸續關閉，未來將為台灣符合 CGMP 標準的製藥廠帶來商機。目前台灣的製藥廠中，已可看到不少 CMO 的影子。
如杏輝接獲具知名度大藥廠楊森製藥、台灣武田、大日本製藥的藥品委託製造的訂單；台灣東洋則接受曼秀雷敦(生產曼秀雷敦；面速力達母)、先靈葆雅、禾利行等國際藥廠訂單；五月十日近期剛簽約購併葛蘭素威康在台新竹藥廠的聯亞，也傳出葛蘭素威康有意將藥品委託給聯亞代工生產；其他如生展、健亞也有接受代工的情形。
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