為了化解黨內續建核四的反彈聲浪，陳水扁曾經以電影《天搖地動》的船長身分自喻，希望能確保船貨平安。對陳水扁而言，在朝大野小的政治現實下，有條件續建核四是暫時閃避政治風暴的權宜之計，不過對反核長達二十多年的民進黨而言，卻是難以承受之輕。
在台灣的反核社運界中，林義雄幾乎已經是「教父級」的地位。九四年，他在全國舉辦反核四公投，千里苦行活動，一頂斗笠、一件汗衫，全程靜默，沒有標語、沒有宣傳車，從墾丁到貢寮，從南到北，踏遍台灣的城市與鄉村，以堅定、不變的步伐，撼動了許多人，在世俗紛擾的時代，林義雄以「沉默」取代發聲，讓反核信念在潛移默化中，深植在民間。
因為安靜，才能感受力道驚人。這一次林義雄在面對核四續建的爭議中，再度顯露了他「安靜」的特質，陳水扁請他進入官邸展開三個小時的懇談，陳水扁動之以情，訴之以理，從終極反核的手段調整到年底反核戰線的延長，希望獲得林義雄的諒解與支持。
不過，林義雄只是聽，並未給陳水扁任何答覆。陳水扁的苦衷，林義雄不是不清楚；但是執政的目的不就是實踐反核理想？如今反核卻被拿來論斤論兩，七折八扣，甚至成為扁政府目前亟欲搬開的執政絆腳石，對反核教父而言，他可諒解，但是無法接受。
所以，林義雄還是沉默地離開總統府，保持他不說、不變但是也令人不安的政治人格特質。他不公開批評扁政府的核四政策，嘴巴不發言，但是他決定參加二十四日反核大遊行，這對陳水扁而言，當林義雄堅毅的步伐再度跨出，幾乎等同用腳抗議，給陳水扁的重擊比在野聯盟還嚴重。因此，陳水扁最近頻頻派出同是宜蘭幫的總統府祕書長游錫●遊說林義雄，希望軟化林義雄的態度。
對陳水扁而言，林義雄不但是地位尊崇的反核教父，更是帶領民進黨取得執政江山的黨主席。尤其在黃信介過世後，林義雄是少數可以在民進黨內幫陳水扁「遮風擋雨」的父執輩。
當初黨內初選時，林義雄一番「信良兄，你不要拿國民黨的錢」，點破了許信良與國民黨之間的互通款曲，讓陳水扁順利在黨內取得正統參選的地位；而進入總統府後，陳水扁無法應付難纏的副手呂秀蓮，林義雄也發揮美麗島老大哥的身分，對呂秀蓮「說重話」，引用美國憲例，「副總統本來就是虛位的。沒事做是應該的」，幫阿扁壓制了呂秀蓮的深宮怨氣。
林義雄對陳水扁而言，如父如師，而林義雄也把陳水扁視為美麗島事件後，民主運動開花結果的新生代瑰寶，愛護有加，只不過，陳水扁這次拿林義雄最堅持的反核四來做政治交換籌碼；當最疼愛的政治後輩，碰上最堅持的政治志業，林義雄心中的掙扎，恐怕不下於陳水扁。
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