與其要說蕭美琴是陳水扁的最愛，還不如說她是歷任民進黨前任主席的最愛，從施明德當主席以降，到許信良、林義雄，沒有人不喜歡這個六十年次、行事頗見圓融、又長得甜美可人、皮膚白皙的女孩！
在一九九五年之前，蕭美琴原本在美國哥倫比亞大學東亞研究所攻讀博士學位，並且在民進黨駐美代表處協助當時的民進黨駐美代表張旭成，及當時還是立委的副總統呂秀蓮推動台灣加入聯合國等業務。施明德有一次訪美時，發現蕭美琴的能力，於是力邀她回台灣到中央黨部任職，外型及能力皆出眾的蕭美琴在黨中央，從組長、副主任，直到許信良當主席時，原任的國際事務部主任李明駿請辭，由蕭美琴接任，當時她二十六歲，成為民進黨有史以來最年輕的一級主管。
從施明德開始，接著的許信良、林義雄，這三任的黨主席，對蕭美琴都極為欣賞和喜愛，因為她的國際視野以及比台語還要流利的英文是民進黨內無人可以取代的，在她當國際部主任的期間，歷任黨主席對她百分之百的信任，從不對她的執行長業務有任何批評。
陳水扁大選期間，扁陣營內最缺少的就是外交人才，在特重美國外交關係的前提下，在美國長大的蕭美琴自然成為阿扁總統借將的第一人選，陳水扁在選戰期間二次赴美，蕭美琴都負責口譯的工作。選後，蕭美琴並不是民進黨國際部唯一到總統府任職的人，和她一起到總統府的人還有劉世忠。
繼金素梅後，蕭美琴這次成為阿扁緋聞的女主角。「說蕭美琴和陳水扁鬧緋聞，這太扯了」，一位總統府核心人士強調。
事實上，蕭美琴還真的有傳過緋聞，只不過對象絕對不是陳水扁，而是過去其他幾位黨政高層人士，例如在總統大選期間，曾經傳出一位黨政高層人士在蕭美琴為陳水扁擔任口譯工作時，因為話說得太多，這位人士體貼地為她倒茶，在場所有的人對這種情景無不感到訝異，於是緋聞之說不脛而走。然而，既然是緋聞，沒有後續的發展，自然無疾而終，沒想到這次竟然傳出和陳水扁相戀更具爆炸性的新聞！
放眼民進黨的外交人才，除了早年旅美的台獨聯盟人士之外，本土的黨內菁英英文流利的人少之又少，而台獨聯盟那一輩的人除了新生代的李應元已赴美出任駐美副代表，其他人大都年事已高，學經歷皆傲人的蕭美琴確實是占盡有利位置，但在新政府上任之後，蕭美琴的雙重國籍問題也一直遭到在野黨批評。
平心而論，蕭美琴和總統府被稱為「童子軍」的馬永成等人有不同的存在價值，她的外交長才，其他人難望其項背，然而，此時傳出和陳水扁的緋聞，而且陳年的戀情又被挖出來，就連她在美國求學期間的男友是鄧小平翻譯的事情也被搬上檯面，重新賦予重大的政治意涵，恐怕是不到三十歲的蕭美琴所難以承受之重！
