十一月十四日晚上八點，國民黨中央黨部發出緊急通知，一通通電話告知中常委，十五日上午九點召開臨時中常會，卻未通知開會內容。剎那間，台北政壇翻騰起來，大家心裡有數，那麼緊急的會議，一定與人事布局有關，而且涉及章孝嚴。因為，早在九二一大地震前，高層就有更動章孝嚴的意思，果不其然，章孝嚴硬是被陣前換將，不過，拔走了章孝嚴，卻意外引進一大堆李總統班底，這也是連戰始料未及之處。可以說，連戰贏了前半場，但李登輝藉機安排後李登輝時期人事，才是真正的贏家。
章孝嚴早就不保了
據了解，國民黨原訂在九月二十八日召開總統大選第一次中央輔選會報，整合各輔選系統步調，而之所以要整合，在於黨部沒有全心投入選戰，連帶使得旁支的輔選機制動不起來，為此，連戰不止一次向李登輝抱怨，不知為何，李登輝都把話題擋了下來，有明顯的挺章動作，因此連陣營也不好說什麼。
但因為競選總部成立在即，連戰點名的一些閣員，在與連戰交心時或多或少提到對章祕書長的顧慮，而關中輔選動作轉趨沉靜，經連戰陣營探詢，又和黨務運作跟不上步伐有關。對此，連戰一直耿耿於懷。
真正讓連陣營覺得不換不行的事件還是國代延任案，國代延任案要討論的當天，連戰有些緊張，因為民意是反對延任，如果國民黨逆勢操作，第一個受到傷害的就是連戰。因此連戰當天慎重其事，親自問章孝嚴，會不會有問題？章孝嚴向連戰拍胸脯說，沒問題，三讀前絕對擋得下來。
結果，章孝嚴不當一回事，半途跑下山來和李登輝吃飯，沒盡責在山上督軍，對此，章孝嚴說，他是看情況緊急，下山向總統報告，其實只是聚餐，這一點連戰心裡有數，尤其是延任案把好不容易上升的民調數字拉下好幾個百分點，連戰心裡很不是滋味。
而接下來的雲林縣長補選作業，章孝嚴處理得大傷國民黨顏面，不只連戰，許多大老都看不下去，覺得把總統大選交給章孝嚴操盤實在太危險。據透露，章孝嚴在人選未定情形下，竟然可以放下鬧烘烘的選情，去日本進行「政黨外交」，面對媒體，章孝嚴可以氣定神閒說提名會議等祕書長回國再議，如此輕忽的態度，章孝嚴結結實實吃了頓排頭。
倉卒回國，迅速開完提名會議後，章孝嚴難掩未從日本赴歐的失望之情，他到雲林宣布提名人選，高分貝地喊著：「祕書長歐洲都不去了，因為雲林補選很重要。」電視播出後，國民黨高層聽得很刺耳，連戰陣營又好氣又好笑地說，雲林縣長選舉如果輸了，祕書長要付相當代價。
章胡心結已深 連戰棄章保胡
結果，果然選輸了，章孝嚴辭職動作是做了出來，但並沒有覺得有什麼特別，他在接受媒體專訪時，內容直指雲林輔選失利。章孝嚴還向妻子黃美倫說，早知道在馬英九選贏時候就走人，見好就收。據了解，李登輝看到這段訪問不怎麼高興，對於張的辭職雖然口頭慰留，但相關人事作業也同時動了起來。
另一個讓連戰想要迅速換掉章孝嚴的原因是胡志強，據了解，這次連戰徵詢胡志強出任競選總部總幹事，胡志強猶豫再三，有相當大的因素是對章孝嚴有所顧。胡志強當然知道出任總幹事將來前途一片大好，不立即答應，主要是覺得上面有個章孝嚴，就算坐上總幹事位子，可能手腳也伸展不開。
當然，當事人是不會承認和誰有過節，十五日國民黨中常會一通過章孝嚴與黃昆輝互換的人事案，媒體立刻大篇幅報導章孝嚴與連陣營、甚至與胡志強的心結。連陣營以前掛在嘴邊的「章孝嚴不走、胡志強不來」，也被媒體大作標題。章孝嚴說，「我和連陣營很好，除了少數人以外，連戰甚至要我做他競選總部副主委」；意思是說，雖然有人拱他，但只是下面的人在搞鬼，連戰和他交情依舊，而且副主委比總幹事大一階。
胡志強也對媒體報導章不走胡不來一事，表示內心十分難過，強調絕無此事。胡志強還說，他有打電話給章孝嚴，表示要去看看他，章孝嚴說，「不用了，你來，媒體會寫更多」。話點到為止，但餘味悠揚。不過話鋒一轉，十六日，胡志強就說，如果沒有更好的人選，要他去接總幹事，他會全力以赴。事實上，和之前的猶豫、推託判若兩人，由此可見，外界對章胡之間的諸多揣測，也有相當的事實成分。看得出連戰倚重胡志強的程度，已經不惜拉下章孝嚴。
李登輝御駕親征不尋常
不過，對胡志強來說，這次人事案，他是全贏，但對連戰來說則未必。因為，章孝嚴請辭、李登輝慰留，到情勢急轉，李登輝十四日召見連戰、蕭萬長、黃昆輝、章孝嚴，親口告訴他們這項決定，短短一個星期的變化，相當驚人，布局之快，也讓連陣營措手不及。
章孝嚴轉任總統府祕書長下台階，是不傷顏面的手法，明年大選完畢，不管誰入主總統府，章孝嚴都要走人，如此安排和當年安撫吳伯雄，給予總統府祕書長位子的手法相同，並不表示李登輝真的喜歡章孝嚴。但其他一連串的人事安排，才是李登輝的重點。
之前，劉泰英已經透露，李總統還會續任黨主席，亦即，連戰就算選上總統，黨的龐大機器，還是握在李登輝手上，這一點，連戰心裡有數，只不過，迅速安排總統人馬在選舉前進駐黨中央，擺出御駕親征的樣子，就有一些不尋常。
據了解，十五日臨時中常會通過這項人事案，有人附和地說，李登輝好比郭子儀，八十歲還可帶兵打勝仗。話是好聽，但聽在連陣營耳裡，滋味不同。因為原本李登輝放手讓連戰經營選戰，現在介入，表示情況緊急，李登輝也不怎麼放心才會在連陣營之上，再安排一個黨中央超級輔選機構，總領其事。據透露，李登輝早在九月，就已經向黃昆輝提及此事，但黃昆輝一直不願意再出馬管黨務。宋楚瑜找上張昭雄配對，民氣一衝，不只支持度上揚，看好率也超過連蕭配許多，這一下子，李登輝決定跳過連戰，親自管這檔事，以免政權不保。
連陣營心裡一定不舒服，不過，人氣低迷是事實，也只好看著李登輝人馬進駐、掌兵符。更悲哀的是，如果民調數字不回升，年底之前，內閣還會進行一次大改組，連閣揆也要換人，而人事主導權還是李登輝握著，連戰雖掛頭牌但實際上仍是配角。
