「除非教育部有明確指示，或是校地恰好處於地震帶上，否則我們絕不輕言遷校，更不可能廢校。」十月四日傍晚，開完臨時擴大行政會議，暨南大學校長李家同很堅定地如此說。
遷校？廢校？如何復校？自震災發生後，這些問題一直困擾著暨南大學校方，眾說紛紜，李家同排除眾議，堅持在最短的時間內復課，在災後短短兩個星期內就完成跟台大、政大、師大商借教室上課的事宜，並決定於十月十三日正式復課，效率之高，令人咋舌。但也引來校內部分員工的不滿，認為這個決策完全是「台北中心」。「對暨南大學付出愈多的人，受的創傷愈大。」多位暨南大學的教授指出，為了專心致力於教學研究工作，他們早就把家眷一起帶到埔里，在當地買房子定居，對他們而言，埔里鎮並不單純只是工作的地點，也是安身立命的第二故鄉。這次在集集大震中也成為災民的他們，只希望能留在埔里鎮，參與災後重建的工作，跟埔里人一起再造新埔里，因此對於校長堅持北上復課的決策法認同。
看電視才知道學校要復校
「學校要復課，我們還是在電視上看到的，復課公告只貼在台北辦事處，校本部根本看不到。」多位留在原校區幫忙處理善後、搶救教學設備的教授指出，震災後校長並未召開臨時校務會議，只片面徵詢教務長、學務長、總務長及科技、管理學院院長的意見，就做出決策。而包括校長在內，這些參與決策的人員半數以上都是外校借調，家居北部，平時只通車南北往返，偶爾住在學校提供的學人宿舍，在災變中幾乎沒什麼個人財物的損失，根本無法體會已在埔里鎮定居的老師的心情。
「我的妻子是小學老師，為了我的工作需要，已請調到埔里教書。這次大地震，目前根本不可能離開工作崗位，跟我一起到台北，我的小孩則被送到遠在高雄的外公外婆家去寄讀，一家三口分住三地，跟『妻離子散』又有何兩樣？」某位教授說，許多暨南大學的教授跟他的處境很像，但因決策已成既成事實，雖然氣憤，也只能無奈地接受。
據了解，暨南大學目前的職員約有百餘人，其中約有三分之二是埔里鎮的在地人，在本次震災中損失大多相當嚴重，對於必須丟下家人獨守家園而北上工作，許多人都感到十分徬徨。這些教職員工表示，暨南大學的校地很大，要興建臨時教室並非難事：「中小學學生可以用臨時教室上課，為什麼大學生不行？」兩名家住埔里鎮的工友則不約而同地指出，家中建築已因震災而毀壞不堪，家裡的孩子都還在上小學，全家只靠他們不到二萬五千元的微薄月薪在過活，雖然北上工作、生活開銷勢將增大，但他們也不敢輕言辭職，因為一旦失業，家人將無以為生。此外，校內多名在職研究生也感到十分困擾，這些在職生的工作地點多在中部地區，當初會選擇到暨南大學進修，主要是因地利之便，未來半年，他們不可能辭去工作，為了上課，勢必得忍受舟車往返之苦，而且還不保證上課時間可以配合，讓他們感到憂心。
對於堅持北上、盡速復課一事，暨南大學校方表示，純粹是為了學生權益的考量。目前暨南大學二千二百多名學生中，約有半數是在震災前一天才報到、住進宿舍的大一新生，興建臨時教室、再將水電系統恢復正常需要一段時間，為了不遲這些新生的學習進度，也避免延誤第一屆大四生畢業的時間，所以才會決定借用台大校舍。不過，李家同說，令他最擔心的還是安全問題：「萬一臨時教室起火，學生受傷，我很難跟檢調單位說，這不是我的責任。」有人建議，將所有學生打散，送到各校上課，李家同也表示無法認同，因為「這樣一來，就形同廢校了！」
寄人籬下 不是辦法
對於這種說法，某些老師私下表示，借用台大教室上課，未必能真正解決學生學習的問題。由於台大師生有教室的優先使用權，「寄人籬下」的暨南大學師生，只能利用中間的空檔排課，很多課程被迫排在晚上，形同夜間部，學生未必感到愉快。而針對多名教職員工的不滿，李家同在臨時擴大行政會議中正式說明校在災後的各項善後措施，並對在時間緊迫所逼下，未及召開校務會議前即倉卒做出決策之事，鄭重提出道歉。
目前，對於決策過程不滿的多位老師已暫時平息怒氣，表示震災造成通訊困難，因此對校方有些許誤解，目前學校處於非常時期，他們也願意共體時艱，配合北上政策，不過他們也希望，日後校方在進行校務決策時能更透明化及民主化。至於各項善後措施，暨南大學學務長高大威指出，在師生宿舍方面，暨南大學以弱勢師生為優先考慮對象，目前校方已向救國團、台北市政府勞工局商借場地，安排數百名僑生住宿在台北學苑及職訓中心，清寒生、受災生、殘障生住在萬芳區的公訓中心，而勞委會也撥下四百萬元款項，修繕台北市勞工局位於新生北路的勞教中心，充當暨南大學的臨時校舍，提供二百多個床位，讓經濟上較有困難的工友等約聘雇職員優先進住。
此外，李家同也指示校內行政單位，在不違反法令的情況下，盡量以雜費、差旅費支出補貼需要南北往返的教職員工，而對於因受災而有特殊家庭困難的教職員，在請假、休假上給予彈性通融，而教職員工在埔里鎮的親屬若有需要，也可借住在原校址的學人宿舍，讓必須北上的教職員工無後顧之憂。
而對於未來暨南大學的發展，行政院副院長劉兆玄表示，可以此次震災經驗為基礎，發展成地震學術研究的重鎮，對於這個建議，李家同表示不排除這個可能性，但需有相關的師資及研究設備配合。
雖然教育部已初步承諾，會在半年內盡全力幫忙修復損毀的建築，讓師生們回到原校地去上課，但是否真能辦得到，誰也不敢拍胸脯保證，一切得視專業建築技師的鑑定結果而定。至於半年後，過了台大借用校地的期限，倘若原校地仍未能完全修復，暨南大學將何去何從，將是對校長李家同及全體師生另一個嚴酷的大挑戰。
一流建材 三流施工品質 暨南大學校舍疑有弊案
根據專家初步認定，暨南大學校地應該不在地震帶上，動輒斥資千萬、上億元的新校舍，為何如此不堪一震，令人深感不解，也引來外界對校舍興建的種種猜測。
多名在暨南大學校區搶救教學設備的教授指出，學校建築採用的都是一流的建材，牆壁上所貼的磁磚多由紐西蘭進口，市價比一般同性質的建材貴上好幾倍，連路燈都是荷蘭進口，「少了一個螺絲釘，都沒辦法維修」。
可惜的是，搭配一流建材的，卻是三流的施工品質。一個月前才剛完工的女生宿舍Ｂ棟，毀損的狀況比其他學生宿舍都來得嚴重許多，而啟用才約五年的行政大，這幾年來一直災情不斷，牆壁早就出現龜裂現象，遇到下大雨時，這棟四樓的建築物居然連二樓天花板都會漏水，天花板早就因此而被泡到腐爛不堪，平日尚且如此，無怪乎經不起規模七‧三的大震。
據了解，暨南大學籌備創校時期的工作，主要由某些新竹師範大學的老師負責，這些委員因為建築物的工程問題，曾被調查局約談，後來整批被換掉，由於此事件當時並未受到外界太多注意，這個事件的調查結果，暨南大學現有的老師並不十分清楚。這次大震，因為校舍嚴重毀損，重新將校內的工程品質問題震上檯面，究竟當初的弊案疑雲該如何撥雲見日，有賴相關單位關心。
