「這場戰役我輸了，但戰爭還沒結束。」藥華藥創辦人暨執行長林國鐘對於歐洲夥伴AOP提出仲裁、導致藥華藥被判賠新台幣48億元的裁判，強調這不是最終結果。在10月21日接到仲裁判斷結果後，藥華藥先是於10月28日實施庫藏股措施，緊接著29日便向德國法院提出撤銷仲裁判斷。
然而，交給德國法院後，仍須12至18個月的審理期間。儘管能讓AOP要求的48億賠償金重新被討論合理與否，然而由於涉及合約爭議，也讓藥華藥在授權AOP的P1101藥物，其權利金的收取同樣陷入不確定狀態。
為什麼AOP這個歐洲合作夥伴，要對藥華藥要求鉅額賠償？「2018年4月，AOP就有提出仲裁，」林國鐘解釋，當時的事件，是由於藥華藥於2017年11月認定AOP符合解約條件，於是向AOP提出解約。
藥華藥的理由是AOP不提供臨床數據，「我們需要臨床數據，不然擔心藥證會延誤，合約上有寫30天內不提供數據自動解約。」2017年10月，藥華藥做出合約應該要自動解除的判斷。
然而，AOP對合約的看法並不相同，林國鐘解釋AOP的認定是「這是一個計畫（Plan），AOP要盡力去達成」，雙方對於時限的要求絕對性，產生歧異。
只不過，一開始藥華藥並沒有注意到AOP的仲裁動機，2018年4月藥華藥公告的重訊提到，「...要求重新厘訂分潤比，但雙方未達成共識...」林國鐘解釋，當時以為是要重新談合約，然而後續才知道，AOP是認為藥華藥的各項延遲，對AOP產生了巨大損失，因此提出仲裁。
2018年6月，藥華藥向國際商會（ICC）提出反仲裁，歷時兩年，國際商會在今年10月21日做出仲裁判斷。關鍵的部分，在於國際商會認為AOP雖然有違約情形，「但是他已經違約修復了。」林國鐘表示，國際商會也提到由於藥華藥持續提供藥物、AOP也繼續提供數據，因此被認定不存在合約解除關係。
在合約被認定有效的情況下，AOP進一步要求藥華藥得為了延遲進度賠償，而國際商會也做出需賠償約48億元的判斷。由於雙方先前的仲裁爭議，藥華藥指出從去年至今出貨給AOP的藥品、約有一億美元的權利金，仍無法認列。
今年上半年藥華藥營收為1.31億元，EPS-2.21，產業分析師指出，假使權利金在今年遲未認列，恐導致藥華藥今年EPS轉正的希望落空。藥華藥回應，目前進度是希望能在第四季完成權利金認列，此外由於提出反仲裁，AOP要求的賠償也還不會認列為虧損。
